MMP3

MMP3
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1B3D, 1B8Y, 1BIW, 1BM6, 1BQO, 1C3I, 1C8T, 1CAQ, 1CIZ, 1CQR, 1D5J, 1D7X, 1D8F, 1D8M, 1G05, 1G49, 1G4K, 1HFS, 1HY7, 1OO9, 1QIA, 1QIC, 1SLM, 1SLN, 1UEA, 1UMS, 1UMT, 1USN, 2D1O, 2JNP, 2JT5, 2JT6, 2SRT, 2USN, 3OHL, 3OHO, 3USN, 4DPE, 4G9L, 4JA1

Ідентифікатори
Символи MMP3, CHDS6, MMP-3, SL-1, STMY, STMY1, STR1, matrix metallopeptidase 3
Зовнішні ІД OMIM: 185250 MGI: 97010 HomoloGene: 20545 GeneCards: MMP3
шифр КФ 3.4.24.17
Реагує на сполуку
cts-1027[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

zinc ion binding
GO:0070122 peptidase activity
endopeptidase activity
metalloendopeptidase activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
hydrolase activity
зв'язування з іоном металу
serine-type endopeptidase activity
metallopeptidase activity

Клітинна компонента

GO:0005578 Позаклітинна матриця
extracellular region
міжклітинний простір

Біологічний процес

collagen catabolic process
cellular response to nitric oxide
negative regulation of hydrogen peroxide metabolic process
extracellular matrix disassembly
протеоліз
positive regulation of protein oligomerization
positive regulation of oxidative stress-induced cell death
cytokine-mediated signaling pathway
response to hypoxia
regulation of cell migration
regulation of neuroinflammatory response
extracellular matrix organization
response to amyloid-beta

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4314
17392
Ensembl
ENSG00000149968
ENSMUSG00000043613
UniProt
P08254
P28862
RefSeq (мРНК)
NM_002422
NM_010809
RefSeq (білок)
NP_002413
NP_034939
Локус (UCSC) Хр. 11: 102.84 – 102.84 Mb Хр. 9: 7.45 – 7.46 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

MMP3 (англ. Matrix metallopeptidase 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 477 амінокислот, а молекулярна маса — 53 977[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MKSLPILLLLCVAVCSAYPLDGAARGEDTSMNLVQKYLENYYDLKKDVKQ
FVRRKDSGPVVKKIREMQKFLGLEVTGKLDSDTLEVMRKPRCGVPDVGHF
RTFPGIPKWRKTHLTYRIVNYTPDLPKDAVDSAVEKALKVWEEVTPLTFS
RLYEGEADIMISFAVREHGDFYPFDGPGNVLAHAYAPGPGINGDAHFDDD
EQWTKDTTGTNLFLVAAHEIGHSLGLFHSANTEALMYPLYHSLTDLTRFR
LSQDDINGIQSLYGPPPDSPETPLVPTEPVPPEPGTPANCDPALSFDAVS
TLRGEILIFKDRHFWRKSLRKLEPELHLISSFWPSLPSGVDAAYEVTSKD
LVFIFKGNQFWAIRGNEVRAGYPRGIHTLGFPPTVRKIDAAISDKEKNKT
YFFVEDKYWRFDEKRNSMEPGFPKQIAEDFPGIDSKIDAVFEEFGFFYFF
TGSSQLEFDPNAKKVTHTLKSNSWLNC

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Nagase H., Enghild J.J., Suzuki K., Salvesen G. (1990). Stepwise activation mechanisms of the precursor of matrix metalloproteinase 3 (stromelysin) by proteinases and (4-aminophenyl)mercuric acetate. Biochemistry. 29: 5783—5789. PMID 2383557 DOI:10.1021/bi00476a020
  • Li Y.C., Zhang X., Melton R., Ganu V., Gonnella N.C. (1998). Solution structure of the catalytic domain of human stromelysin-1 complexed to a potent, nonpeptidic inhibitor. Biochemistry. 37: 14048—14056. PMID 9760240 DOI:10.1021/bi981328w

Примітки

  1. Сполуки, які фізично взаємодіють з MMP3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7173 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
  5. UniProt, P08254 (англ.) . Архів оригіналу за 6 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 11
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.
  • п
  • о
  • р
Протеази: металоендопептидази (EC 3.4.24)
Білки ADAM
Матриксні металопротеїнази

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»