Рибосомний білок S3

Рибосомний білок S3
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1WH9, 4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 3J7P, 4UJE, 4D5L, 3J7R, 4UJD, 4V5Z, 5FLX, 4D61, 4UJC

Ідентифікатори
Символи RPS3, S3, ribosomal protein S3
Зовнішні ІД OMIM: 600454 MGI: 1350917 HomoloGene: 779 GeneCards: RPS3
Онтологія гена
Молекулярна функція

• tubulin binding
• DNA N-glycosylase activity
• small ribosomal subunit rRNA binding
• iron-sulfur cluster binding
• transcription factor binding
• oxidized purine DNA binding
• Hsp70 protein binding
• lyase activity
• enzyme binding
• mRNA binding
• structural constituent of ribosome
• damaged DNA binding
• ubiquitin-like protein conjugating enzyme binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity
• oxidized pyrimidine DNA binding
• endodeoxyribonuclease activity
• protein kinase binding
• supercoiled DNA binding
• DNA binding
• Hsp90 protein binding
• microtubule binding
• protein kinase A binding
• RNA binding
• kinase binding
• RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
• GO:0032403 protein-containing complex binding
• class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity
• class III/IV DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity
• oxidized purine nucleobase lesion DNA N-glycosylase activity

Клітинна компонента

• цитоплазма
• гіалоплазма
• Полісома
• мембрана
• focal adhesion
• ruffle membrane
• мітохондрія
• цитоскелет
• клітинне ядро
• рибосома
• ядерце
• екзосома
• клітинна мембрана
• веретено поділу
• мітохондріальний матрикс
• small ribosomal subunit
• mitotic spindle
• мітохондріальна внутрішня мембрана
• cytosolic small ribosomal subunit
• нуклеоплазма
• GO:0005578 Позаклітинна матриця
• ендоплазматичний ретикулум
• NF-kappaB complex
• GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення
• Рибонуклеопротеїни
• синапс

Біологічний процес

• chromosome segregation
• positive regulation of endodeoxyribonuclease activity
• cellular response to DNA damage stimulus
• positive regulation of microtubule polymerization
• клітинний цикл
• GO:0097285 апоптоз
• negative regulation of translation
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
• viral transcription
• response to TNF agonist
• positive regulation of apoptotic signaling pathway
• GO:0001306 response to oxidative stress
• transcription, DNA-templated
• SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
• positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis
• positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage
• positive regulation of DNA N-glycosylase activity
• positive regulation of JUN kinase activity
• nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
• negative regulation of DNA repair
• GO:1900404 positive regulation of DNA repair
• positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling
• поділ клітини
• spindle assembly
• negative regulation of protein ubiquitination
• GO:1901313 positive regulation of gene expression
• translational initiation
• regulation of translation
• cellular response to hydrogen peroxide
• Біосинтез білків
• positive regulation of base-excision repair
• GO:0100026 Репарація ДНК
• regulation of apoptotic process
• rRNA processing
• cytoplasmic translation
• positive regulation of protein-containing complex assembly
• positive regulation of interleukin-2 production
• positive regulation of activated T cell proliferation
• positive regulation of T cell receptor signaling pathway
• positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity
• cellular response to tumor necrosis factor

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6188
27050
Ensembl
ENSG00000149273
ENSMUSG00000030744
UniProt
P23396
P62908
RefSeq (мРНК)
NM_001260507
NM_001005
NM_001256802
NM_001260506
NM_012052
RefSeq (білок)
NP_000996
NP_001243731
NP_001247435
NP_001247436
NP_036182
Локус (UCSC) Хр. 11: 75.4 – 75.42 Mb Хр. 7: 99.13 – 99.13 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Рибосомний білок S3 (англ. Ribosomal protein S3) – білок, який кодується геном RPS3, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 243 амінокислот, а молекулярна маса — 26 688[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAVQISKKRKFVADGIFKAELNEFLTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIII
LATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIA
QAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSM
KFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPTGKIGP
KKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTA

Цей білок за функціями належить до ліаз, рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мітоз. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, мітохондрії, внутрішній мембрані мітохондрії.

Література

  • Zhang X.T., Tan Y.M., Tan Y.H. (1990). Isolation of a cDNA encoding human 40S ribosomal protein s3. Nucleic Acids Res. 18: 6689—6689. PMID 2129557 DOI:10.1093/nar/18.22.6689
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Tycowski K.T., Shu M.D., Steitz J.A. (1993). A small nucleolar RNA is processed from an intron of the human gene encoding ribosomal protein S3. Genes Dev. 7: 1176—1190. PMID 8319909 DOI:10.1101/gad.7.7a.1176
  • Hegde V., Wang M., Deutsch W.A. (2004). Human ribosomal protein S3 interacts with DNA base excision repair proteins hAPE/Ref-1 and hOGG1. Biochemistry. 43: 14211—14217. PMID 15518571 DOI:10.1021/bi049234b
  • Hegde V., Wang M., Deutsch W.A. (2004). Characterization of human ribosomal protein S3 binding to 7,8-dihydro-8-oxoguanine and abasic sites by surface plasmon resonance. DNA Repair. 3: 121—126. PMID 14706345 DOI:10.1016/j.dnarep.2003.10.004
  • Jang C.Y., Lee J.Y., Kim J. (2004). RpS3, a DNA repair endonuclease and ribosomal protein, is involved in apoptosis. FEBS Lett. 560: 81—85. PMID 14988002 DOI:10.1016/S0014-5793(04)00074-2

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10420 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
  4. ↑ UniProt, P23396 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

  • Хромосома 11
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Біосинтез білків: трансляція (трансляція прокаріотів, трансляція еукаріотів)
Білки
Фактори ініціації трансляції
Фактори ініціації трансляції прокаріотів
  • PIF-1
  • PIF-2
  • PIF-3
Фактори ініціації трансляції археїв
  • aIF1
  • aIF2
  • aIF5
  • aIF6
Фактори ініціації трансляції еукаріотів
eIF1
eIF2
eIF3
eIF4
eIF5
eIF6
Фактори елонгації трансляції
Фактори елонгації трансляції прокаріотів
  • EF-Tu
  • EF-Ts
  • EF-G
Фактори елонгації трансляції археїв
  • aEF-1, aEF-2
Фактори елонгації трансляції еукаріотів
Фактори термінації трансляції
  • Фактори термінації трансляції прокаріотів
  • Фактори термінації трансляції археїв
  • Фактори термінації трансляції еукаріотів
Рибосомні білки
Цитоплазмові
підрозділ 60S
підрозділ 40S
Мітохондріальні
підрозділ 39S
підрозділ 28S