RPL13A |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4UG0, 4V6X, 5AJ0, 4UJD, 4D67, 4D5Y, 4UJE, 4UJC | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RPL13A, L13A, TSTA1, ribosomal protein L13a |
---|
Зовнішні ІД | MGI: 1351455 HomoloGene: 111053 GeneCards: RPL13A |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • mRNA binding • RNA binding • structural constituent of ribosome |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • рибосома • мембрана • focal adhesion • large ribosomal subunit • ядерце • GAIT complex • cytosolic large ribosomal subunit • клітинне ядро • Рибонуклеопротеїни |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of translation • viral transcription • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane • negative regulation of formation of translation preinitiation complex • cellular response to interferon-gamma • translational initiation • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • regulation of translation • Біосинтез білків • rRNA processing |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 49.49 – 49.49 Mb | Хр. 7: 44.77 – 44.78 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RPL13A (англ. Ribosomal protein L13a) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 203 амінокислот, а молекулярна маса — 23 577[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAEVQVLVLD | | GRGHLLGRLA | | AIVAKQVLLG | | RKVVVVRCEG | | INISGNFYRN |
KLKYLAFLRK | | RMNTNPSRGP | | YHFRAPSRIF | | WRTVRGMLPH | | KTKRGQAALD |
RLKVFDGIPP | | PYDKKKRMVV | | PAALKVVRLK | | PTRKFAYLGR | | LAHEVGWKYQ |
AVTATLEEKR | | KEKAKIHYRK | | KKQLMRLRKQ | | AEKNVEKKID | | KYTEVLKTHG |
LLV |
Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- Higa S., Yoshihama M., Tanaka T., Kenmochi N. (1999). Gene organization and sequence of the region containing the ribosomal protein genes RPL13A and RPS11 in the human genome and conserved features in the mouse genome. Gene. 240: 371—377. PMID 10580157 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00429-1
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Arif A., Chatterjee P., Moodt R.A., Fox P.L. (2012). Heterotrimeric GAIT complex drives transcript-selective translation inhibition in murine macrophages. Mol. Cell. Biol. 32: 5046—5055. PMID 23071094 DOI:10.1128/MCB.01168-12
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10304 (англ.) . Архів оригіналу за 11 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P40429 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Білки | Фактори ініціації трансляції | Фактори ініціації трансляції прокаріотів | |
---|
Фактори ініціації трансляції археїв | |
---|
Фактори ініціації трансляції еукаріотів | |
---|
|
---|
Фактори елонгації трансляції | Фактори елонгації трансляції прокаріотів | |
---|
Фактори елонгації трансляції археїв | |
---|
Фактори елонгації трансляції еукаріотів | |
---|
|
---|
Фактори термінації трансляції | - Фактори термінації трансляції прокаріотів
- Фактори термінації трансляції археїв
- Фактори термінації трансляції еукаріотів
|
---|
Рибосомні білки | Цитоплазмові | підрозділ 60S | |
---|
підрозділ 40S | |
---|
|
---|
Мітохондріальні | підрозділ 39S | |
---|
підрозділ 28S | |
---|
|
---|
|
---|
|
---|