EIF3F |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3J8B, 3J8C | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | EIF3F, EIF3S5, eIF3-p47, eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, MRT67 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603914 MGI: 1913335 HomoloGene: 2783 GeneCards: EIF3F |
---|
шифр КФ | 3.4.19.12 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
депресія клінічна[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • cysteine-type peptidase activity • translation initiation factor activity • thiol-dependent deubiquitinase • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • translation initiation factor binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • eukaryotic translation initiation factor 3 complex • мембрана • eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m • eukaryotic 43S preinitiation complex • eukaryotic 48S preinitiation complex |
---|
Біологічний процес | • протеоліз • translational initiation • Біосинтез білків • IRES-dependent viral translational initiation • protein deubiquitination • formation of cytoplasmic translation initiation complex • cytoplasmic translational initiation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 7.97 – 8 Mb | Хр. 7: 108.53 – 108.54 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
EIF3F (англ. Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 357 амінокислот, а молекулярна маса — 37 564[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MATPAVPVSA | | PPATPTPVPA | | AAPASVPAPT | | PAPAAAPVPA | | AAPASSSDPA |
AAAAATAAPG | | QTPASAQAPA | | QTPAPALPGP | | ALPGPFPGGR | | VVRLHPVILA |
SIVDSYERRN | | EGAARVIGTL | | LGTVDKHSVE | | VTNCFSVPHN | | ESEDEVAVDM |
EFAKNMYELH | | KKVSPNELIL | | GWYATGHDIT | | EHSVLIHEYY | | SREAPNPIHL |
TVDTSLQNGR | | MSIKAYVSTL | | MGVPGRTMGV | | MFTPLTVKYA | | YYDTERIGVD |
LIMKTCFSPN | | RVIGLSSDLQ | | QVGGASARIQ | | DALSTVLQYA | | EDVLSGKVSA |
DNTVGRFLMS | | LVNQVPKIVP | | DDFETMLNSN | | INDLLMVTYL | | ANLTQSQIAL |
NEKLVNL |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, факторів ініціації, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як біосинтез білка, убіквітинування білків. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Holz M.K., Ballif B.A., Gygi S.P., Blenis J. (2005). mTOR and S6K1 mediate assembly of the translation preinitiation complex through dynamic protein interchange and ordered phosphorylation events. Cell. 123: 569—580. PMID 16286006 DOI:10.1016/j.cell.2005.10.024
- Kolupaeva V.G., Unbehaun A., Lomakin I.B., Hellen C.U.T., Pestova T.V. (2005). Binding of eukaryotic initiation factor 3 to ribosomal 40S subunits and its role in ribosomal dissociation and anti-association. RNA. 11: 470—486. PMID 15703437 DOI:10.1261/rna.7215305
- Masutani M., Sonenberg N., Yokoyama S., Imataka H. (2007). Reconstitution reveals the functional core of mammalian eIF3. EMBO J. 26: 3373—3383. PMID 17581632 DOI:10.1038/sj.emboj.7601765
- Lee A.S., Kranzusch P.J., Cate J.H. (2015). eIF3 targets cell-proliferation messenger RNAs for translational activation or repression. Nature. 522: 111—114. PMID 25849773 DOI:10.1038/nature14267
- Lee A.S., Kranzusch P.J., Doudna J.A., Cate J.H. (2016). eIF3d is an mRNA cap-binding protein that is required for specialized translation initiation. Nature. 536: 96—99. PMID 27462815 DOI:10.1038/nature18954
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з EIF3F переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3275 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 21 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O00303 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Білки | Фактори ініціації трансляції | Фактори ініціації трансляції прокаріотів | |
---|
Фактори ініціації трансляції археїв | |
---|
Фактори ініціації трансляції еукаріотів | |
---|
|
---|
Фактори елонгації трансляції | Фактори елонгації трансляції прокаріотів | |
---|
Фактори елонгації трансляції археїв | |
---|
Фактори елонгації трансляції еукаріотів | |
---|
|
---|
Фактори термінації трансляції | - Фактори термінації трансляції прокаріотів
- Фактори термінації трансляції археїв
- Фактори термінації трансляції еукаріотів
|
---|
Рибосомні білки | Цитоплазмові | підрозділ 60S | |
---|
підрозділ 40S | |
---|
|
---|
Мітохондріальні | підрозділ 39S | |
---|
підрозділ 28S | |
---|
|
---|
|
---|
|
---|