EIF3L |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3J8B, 3J8C | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | EIF3L, EIF3EIP, EIF3S11, EIF3S6IP, HSPC021, HSPC025, MSTP005, eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L |
---|
Зовнішні ІД | MGI: 2386251 HomoloGene: 9380 GeneCards: EIF3L |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • translation initiation factor activity • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • ядерце • мембрана • fibrillar center • гіалоплазма • нуклеоплазма • цитоплазма • eukaryotic translation initiation factor 3 complex • eukaryotic 43S preinitiation complex • eukaryotic 48S preinitiation complex |
---|
Біологічний процес | • translational initiation • viral translational termination-reinitiation • Біосинтез білків • formation of cytoplasmic translation initiation complex • cytoplasmic translational initiation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/1a/PBB_GE_EIF3S6IP_217719_at_fs.png/250px-PBB_GE_EIF3S6IP_217719_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001242923 NM_016091 NM_001363785 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001229852 NP_057175 NP_001350714 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 22: 37.85 – 37.89 Mb | Хр. 15: 78.96 – 78.98 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
EIF3L (англ. Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 564 амінокислот, а молекулярна маса — 66 727[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSYPADDYES | | EAAYDPYAYP | | SDYDMHTGDP | | KQDLAYERQY | | EQQTYQVIPE |
VIKNFIQYFH | | KTVSDLIDQK | | VYELQASRVS | | SDVIDQKVYE | | IQDIYENSWT |
KLTERFFKNT | | PWPEAEAIAP | | QVGNDAVFLI | | LYKELYYRHI | | YAKVSGGPSL |
EQRFESYYNY | | CNLFNYILNA | | DGPAPLELPN | | QWLWDIIDEF | | IYQFQSFSQY |
RCKTAKKSEE | | EIDFLRSNPK | | IWNVHSVLNV | | LHSLVDKSNI | | NRQLEVYTSG |
GDPESVAGEY | | GRHSLYKMLG | | YFSLVGLLRL | | HSLLGDYYQA | | IKVLENIELN |
KKSMYSRVPE | | CQVTTYYYVG | | FAYLMMRRYQ | | DAIRVFANIL | | LYIQRTKSMF |
QRTTYKYEMI | | NKQNEQMHAL | | LAIALTMYPM | | RIDESIHLQL | | REKYGDKMLR |
MQKGDPQVYE | | ELFSYSCPKF | | LSPVVPNYDN | | VHPNYHKEPF | | LQQLKVFSDE |
VQQQAQLSTI | | RSFLKLYTTM | | PVAKLAGFLD | | LTEQEFRIQL | | LVFKHKMKNL |
VWTSGISALD | | GEFQSASEVD | | FYIDKDMIHI | | ADTKVARRYG | | DFFIRQIHKF |
EELNRTLKKM | | GQRP |
Кодований геном білок за функціями належить до факторів ініціації, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біосинтез білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Morris-Desbois C., Rety S., Ferro M., Garin J., Jalinot P. (2001). The human protein HSPC021 interacts with Int-6 and is associated with eukaryotic translation initiation factor 3. J. Biol. Chem. 276: 45988—45995. PMID 11590142 DOI:10.1074/jbc.M104966200
- Yuan X., Zhao J., Zentgraf H., Hoffmann-Rohrer U., Grummt I. (2002). Multiple interactions between RNA polymerase I, TIF-IA and TAF(I) subunits regulate preinitiation complex assembly at the ribosomal gene promoter. EMBO Rep. 3: 1082—1087. PMID 12393749 DOI:10.1093/embo-reports/kvf212
- Kolupaeva V.G., Unbehaun A., Lomakin I.B., Hellen C.U.T., Pestova T.V. (2005). Binding of eukaryotic initiation factor 3 to ribosomal 40S subunits and its role in ribosomal dissociation and anti-association. RNA. 11: 470—486. PMID 15703437 DOI:10.1261/rna.7215305
- Masutani M., Sonenberg N., Yokoyama S., Imataka H. (2007). Reconstitution reveals the functional core of mammalian eIF3. EMBO J. 26: 3373—3383. PMID 17581632 DOI:10.1038/sj.emboj.7601765
- Poyry T.A., Kaminski A., Connell E.J., Fraser C.S., Jackson R.J. (2007). The mechanism of an exceptional case of reinitiation after translation of a long ORF reveals why such events do not generally occur in mammalian mRNA translation. Genes Dev. 21: 3149—3162. PMID 18056426 DOI:10.1101/gad.439507
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18138 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y262 (англ.) . Архів оригіналу за 9 березня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Білки | Фактори ініціації трансляції | Фактори ініціації трансляції прокаріотів | |
---|
Фактори ініціації трансляції археїв | |
---|
Фактори ініціації трансляції еукаріотів | |
---|
|
---|
Фактори елонгації трансляції | Фактори елонгації трансляції прокаріотів | |
---|
Фактори елонгації трансляції археїв | |
---|
Фактори елонгації трансляції еукаріотів | |
---|
|
---|
Фактори термінації трансляції | - Фактори термінації трансляції прокаріотів
- Фактори термінації трансляції археїв
- Фактори термінації трансляції еукаріотів
|
---|
Рибосомні білки | Цитоплазмові | підрозділ 60S | |
---|
підрозділ 40S | |
---|
|
---|
Мітохондріальні | підрозділ 39S | |
---|
підрозділ 28S | |
---|
|
---|
|
---|
|
---|