EEF1D |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2MVM, 2MVN, 2N51 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | EEF1D, EF-1D, EF1D, FP1047, eukaryotic translation elongation factor 1 delta |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 130592 MGI: 1913906 HomoloGene: 23404 GeneCards: EEF1D |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • heat shock protein binding • translation factor activity, RNA binding • signal transducer activity • translation elongation factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cadherin binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро • eukaryotic translation elongation factor 1 complex • fibrillar center • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of cell death • translational elongation • mRNA transcription • transcription, DNA-templated • cellular response to ionizing radiation • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • GO:0072468 сигнальна трансдукція • Біосинтез білків |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000104529 ENSG00000273594 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001130053 NM_001130054 NM_001130055 NM_001130056 NM_001130057
| NM_001195203 NM_001289950 NM_001960 NM_032378 NM_001317743 NM_001330646 |
| NM_001285429 NM_001285430 NM_001285431 NM_001285432 NM_001285433
| NM_001285434 NM_023240 NM_029663 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001123525 NP_001123527 NP_001123528 NP_001123529 NP_001182132
| NP_001276879 NP_001304672 NP_001317575 NP_001951 NP_115754 |
| NP_001272358 NP_001272359 NP_001272360 NP_001272361 NP_001272362
| NP_001272363 NP_075729 NP_083939 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 8: 143.58 – 143.6 Mb | Хр. 15: 75.77 – 75.78 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
EEF1D (англ. Eukaryotic translation elongation factor 1 delta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 281 амінокислот, а молекулярна маса — 31 122[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MATNFLAHEK | | IWFDKFKYDD | | AERRFYEQMN | | GPVAGASRQE | | NGASVILRDI |
ARARENIQKS | | LAGSSGPGAS | | SGTSGDHGEL | | VVRIASLEVE | | NQSLRGVVQE |
LQQAISKLEA | | RLNVLEKSSP | | GHRATAPQTQ | | HVSPMRQVEP | | PAKKPATPAE |
DDEDDDIDLF | | GSDNEEEDKE | | AAQLREERLR | | QYAEKKAKKP | | ALVAKSSILL |
DVKPWDDETD | | MAQLEACVRS | | IQLDGLVWGA | | SKLVPVGYGI | | RKLQIQCVVE |
DDKVGTDLLE | | EEITKFEEHV | | QSVDIAAFNK | | I |
Кодований геном білок за функціями належить до факторів елонгації, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біосинтез білка, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Sanders J.P., Raggiaschi R., Morales J., Moeller W. (1993). The human leucine zipper-containing guanine-nucleotide exchange protein elongation factor-1 delta. Biochim. Biophys. Acta. 1174: 87—90. PMID 8334168 DOI:10.1016/0167-4781(93)90097-W
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Chacko G., Ling Q., Hajjar K.A. (1998). Induction of acute translational response genes by homocysteine. Elongation factors-1alpha, -beta, and -delta. J. Biol. Chem. 273: 19840—19846. PMID 9677419 DOI:10.1074/jbc.273.31.19840
- Beranova-Giorgianni S., Zhao Y., Desiderio D.M., Giorgianni F. (2006). Phosphoproteomic analysis of the human pituitary. Pituitary. 9: 109—120. PMID 16807684 DOI:10.1007/s11102-006-8916-x
- Giorgianni F., Zhao Y., Desiderio D.M., Beranova-Giorgianni S. (2007). Toward a global characterization of the phosphoproteome in prostate cancer cells: identification of phosphoproteins in the LNCaP cell line. Electrophoresis. 28: 2027—2034. PMID 17487921 DOI:10.1002/elps.200600782
- Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3211 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P29692 (англ.) . Архів оригіналу за 12 січня 2018. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Білки | Фактори ініціації трансляції | Фактори ініціації трансляції прокаріотів | |
---|
Фактори ініціації трансляції археїв | |
---|
Фактори ініціації трансляції еукаріотів | |
---|
|
---|
Фактори елонгації трансляції | Фактори елонгації трансляції прокаріотів | |
---|
Фактори елонгації трансляції археїв | |
---|
Фактори елонгації трансляції еукаріотів | |
---|
|
---|
Фактори термінації трансляції | - Фактори термінації трансляції прокаріотів
- Фактори термінації трансляції археїв
- Фактори термінації трансляції еукаріотів
|
---|
Рибосомні білки | Цитоплазмові | підрозділ 60S | |
---|
підрозділ 40S | |
---|
|
---|
Мітохондріальні | підрозділ 39S | |
---|
підрозділ 28S | |
---|
|
---|
|
---|
|
---|
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |