H2AFY

MACROH2A1
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتينOrtholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين

1U35, 1ZR3, 1ZR5, 2F8N, 2FXK, 3HQH, 3HSV, 3IID, 3IIF, 3IVB, 5IIT

معرفات
أسماء بديلة MACROH2A1, H2A.y, H2A/y, H2AF12M, H2AFJ, .1, mH2A1, macroH2A1.2, H2A histone family member Y, H2AFY, macroH2A.1 histone
معرفات خارجية الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 610054 MGI: MGI:1349392 HomoloGene: 3598 GeneCards: 9555
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية

protein kinase binding
rDNA binding
protein serine/threonine kinase inhibitor activity
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
chromatin binding
double-stranded methylated DNA binding
protein heterodimerization activity
RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding
core promoter sequence-specific DNA binding
ربط دي إن إي
chromatin DNA binding
enzyme binding
‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني
nucleosomal DNA binding
promoter-specific chromatin binding

مكونات خلوية

حويصلة خارج خلوية
ESC/E(Z) complex
نوية
condensed chromosome
صبغي
pericentric heterochromatin
جسيم نووي
نواة
nuclear chromosome
sex chromatin
جسم بار
كروماتين

عمليات حيوية

negative regulation of histone H3-K4 methylation
regulation of ribosomal DNA heterochromatin assembly
dosage compensation
negative regulation of cell cycle G2/M phase transition
epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation
regulation of cell growth
positive regulation of keratinocyte differentiation
negative regulation of protein serine/threonine kinase activity
‏GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
nucleosome assembly
negative regulation of protein localization to chromosome, telomeric region
negative regulation of gene expression, epigenetic
negative regulation of histone H3-K27 methylation
regulation of gene expression, epigenetic
positive regulation of maintenance of mitotic sister chromatid cohesion
establishment of protein localization to chromatin
negative regulation of transcription of nucleolar large rRNA by RNA polymerase I
regulation of lipid metabolic process
regulation of response to oxidative stress
negative regulation of response to oxidative stress
positive regulation of response to oxidative stress
‏GO:0031497، ‏GO:0006336، ‏GO:0034724، ‏GO:0001301، ‏GO:0007580، ‏GO:0034652، ‏GO:0010847 chromatin organization

المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي




المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
أنواع الإنسان الفأر
أنتريه 9555 26914
Ensembl ENSG00000113648 ENSMUSG00000015937
يونيبروت

O75367

Q9QZQ8

RefSeq (رنا مرسال.)

‏NM_001040158، ‏NM_004893، ‏NM_138609، ‏NM_138610، ‏XM_005272132، ‏XM_005272134، ‏XM_005272135، ‏XM_011543729، ‏XM_011543730، ‏XM_011543731، ‏XM_011543732، ‏XM_011543733، ‏XM_011543734، ‏XM_011543735، ‏XR_948306، ‏XR_948307، ‏XR_948308، ‏XR_948309، ‏XR_948310، ‏XM_017010067، ‏XM_017010068، ‏XR_001742353، ‏XR_001742354، ‏XR_001742355، ‏XR_001742356، ‏XR_001742357، ‏XR_001742358، ‏XR_001742359، ‏XM_024446263، ‏XM_024446264 XR_948311، ‏NM_001040158، ‏NM_004893، ‏NM_138609، ‏NM_138610، ‏XM_005272132، ‏XM_005272134، ‏XM_005272135، ‏XM_011543729، ‏XM_011543730، ‏XM_011543731، ‏XM_011543732، ‏XM_011543733، ‏XM_011543734، ‏XM_011543735، ‏XR_948306، ‏XR_948307، ‏XR_948308، ‏XR_948309، ‏XR_948310، ‏XM_017010067، ‏XM_017010068، ‏XR_001742353، ‏XR_001742354، ‏XR_001742355، ‏XR_001742356، ‏XR_001742357، ‏XR_001742358، ‏XR_001742359، ‏XM_024446263، ‏XM_024446264

‏NM_001159514، ‏NM_001159515، ‏NM_012015، ‏XM_006517257، ‏XM_006517258، ‏XR_382440، ‏XR_001780784، ‏XR_001780785، ‏XR_001780786، ‏XR_003950455، ‏XR_003950456، ‏XR_003950457، ‏XR_003950458 NM_001159513، ‏NM_001159514، ‏NM_001159515، ‏NM_012015، ‏XM_006517257، ‏XM_006517258، ‏XR_382440، ‏XR_001780784، ‏XR_001780785، ‏XR_001780786، ‏XR_003950455، ‏XR_003950456، ‏XR_003950457، ‏XR_003950458

RefSeq (بروتين)

‏NP_004884، ‏NP_613075، ‏NP_613258، ‏XP_005272189، ‏XP_005272191، ‏XP_005272192، ‏XP_011542031، ‏XP_011542032، ‏XP_011542033، ‏XP_011542034، ‏XP_011542035، ‏XP_011542036، ‏XP_011542037، ‏XP_016865556، ‏XP_016865557، ‏XP_024302031، ‏XP_024302032 NP_001035248، ‏NP_004884، ‏NP_613075، ‏NP_613258، ‏XP_005272189، ‏XP_005272191، ‏XP_005272192، ‏XP_011542031، ‏XP_011542032، ‏XP_011542033، ‏XP_011542034، ‏XP_011542035، ‏XP_011542036، ‏XP_011542037، ‏XP_016865556، ‏XP_016865557، ‏XP_024302031، ‏XP_024302032

‏NP_001152986، ‏NP_001152987، ‏NP_036145، ‏XP_006517320، ‏XP_006517321 NP_001152985، ‏NP_001152986، ‏NP_001152987، ‏NP_036145، ‏XP_006517320، ‏XP_006517321

الموقع (UCSC n/a Chr 13: 56.22 – 56.28 Mb
بحث ببمد [1] [2]
ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنساناعرض/عدّل فأر

H2AFY‏ (H2A histone family member Y) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين H2AFY في الإنسان.[1][2][3]

الوظيفة

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

الأهمية السريرية

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

المراجع

  1. ^ Lee Y، Hong M، Kim JW، Hong YM، Choe YK، Chang SY، Lee KS، Choe IS (يوليو 1998). "Isolation of cDNA clones encoding human histone macroH2A1 subtypes". Biochimica et Biophysica Acta. ج. 1399 ع. 1: 73–7. DOI:10.1016/s0167-4781(98)00098-0. PMID:9714746.
  2. ^ "Entrez Gene: H2AFY H2A histone family, member Y". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.
  3. ^ Mao M، Fu G، Wu JS، Zhang QH، Zhou J، Kan LX، Huang QH، He KL، Gu BW، Han ZG، Shen Y، Gu J، Yu YP، Xu SH، Wang YX، Chen SJ، Chen Z (يوليو 1998). "Identification of genes expressed in human CD34(+) hematopoietic stem/progenitor cells by expressed sequence tags and efficient full-length cDNA cloning". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 95 ع. 14: 8175–80. DOI:10.1073/pnas.95.14.8175. PMC:20949. PMID:9653160.

قراءة متعمقة

  • El Kharroubi A، Piras G، Zensen R، Martin MA (مايو 1998). "Transcriptional activation of the integrated chromatin-associated human immunodeficiency virus type 1 promoter". Molecular and Cellular Biology. ج. 18 ع. 5: 2535–44. DOI:10.1128/mcb.18.5.2535. PMC:110633. PMID:9566873.
  • Costanzi C، Pehrson JR (يونيو 1998). "Histone macroH2A1 is concentrated in the inactive X chromosome of female mammals". Nature. ج. 393 ع. 6685: 599–601. DOI:10.1038/31275. PMID:9634239.
  • Zhang QH، Ye M، Wu XY، Ren SX، Zhao M، Zhao CJ، Fu G، Shen Y، Fan HY، Lu G، Zhong M، Xu XR، Han ZG، Zhang JW، Tao J، Huang QH، Zhou J، Hu GX، Gu J، Chen SJ، Chen Z (أكتوبر 2000). "Cloning and functional analysis of cDNAs with open reading frames for 300 previously undefined genes expressed in CD34+ hematopoietic stem/progenitor cells". Genome Research. ج. 10 ع. 10: 1546–60. DOI:10.1101/gr.140200. PMC:310934. PMID:11042152.
  • Deng L، de la Fuente C، Fu P، Wang L، Donnelly R، Wade JD، Lambert P، Li H، Lee CG، Kashanchi F (نوفمبر 2000). "Acetylation of HIV-1 Tat by CBP/P300 increases transcription of integrated HIV-1 genome and enhances binding to core histones". Virology. ج. 277 ع. 2: 278–95. DOI:10.1006/viro.2000.0593. PMID:11080476.
  • Chadwick BP، Willard HF (مايو 2001). "Histone H2A variants and the inactive X chromosome: identification of a second macroH2A variant". Human Molecular Genetics. ج. 10 ع. 10: 1101–13. DOI:10.1093/hmg/10.10.1101. PMID:11331621.
  • Deng L، Wang D، de la Fuente C، Wang L، Li H، Lee CG، Donnelly R، Wade JD، Lambert P، Kashanchi F (أكتوبر 2001). "Enhancement of the p300 HAT activity by HIV-1 Tat on chromatin DNA". Virology. ج. 289 ع. 2: 312–26. DOI:10.1006/viro.2001.1129. PMID:11689053.
  • Chadwick BP، Willard HF (يونيو 2002). "Cell cycle-dependent localization of macroH2A in chromatin of the inactive X chromosome". The Journal of Cell Biology. ج. 157 ع. 7: 1113–23. DOI:10.1083/jcb.200112074. PMC:2173542. PMID:12082075.
  • Takahashi I، Kameoka Y، Hashimoto K (أغسطس 2002). "MacroH2A1.2 binds the nuclear protein Spop". Biochimica et Biophysica Acta. ج. 1591 ع. 1–3: 63–8. DOI:10.1016/S0167-4889(02)00249-5. PMID:12183056.
  • Ganesan S، Silver DP، Greenberg RA، Avni D، Drapkin R، Miron A، Mok SC، Randrianarison V، Brodie S، Salstrom J، Rasmussen TP، Klimke A، Marrese C، Marahrens Y، Deng CX، Feunteun J، Livingston DM (نوفمبر 2002). "BRCA1 supports XIST RNA concentration on the inactive X chromosome". Cell. ج. 111 ع. 3: 393–405. DOI:10.1016/S0092-8674(02)01052-8. PMID:12419249.
  • Angelov D، Molla A، Perche PY، Hans F، Côté J، Khochbin S، Bouvet P، Dimitrov S (أبريل 2003). "The histone variant macroH2A interferes with transcription factor binding and SWI/SNF nucleosome remodeling". Molecular Cell. ج. 11 ع. 4: 1033–41. DOI:10.1016/S1097-2765(03)00100-X. PMID:12718888.
  • Behrends U، Schneider I، Rössler S، Frauenknecht H، Golbeck A، Lechner B، Eigenstetter G، Zobywalski C، Müller-Weihrich S، Graubner U، Schmid I، Sackerer D، Späth M، Goetz C، Prantl F، Asmuss HP، Bise K، Mautner J (أغسطس 2003). "Novel tumor antigens identified by autologous antibody screening of childhood medulloblastoma cDNA libraries". International Journal of Cancer. ج. 106 ع. 2: 244–51. DOI:10.1002/ijc.11208. PMID:12800201.
  • Lusic M، Marcello A، Cereseto A، Giacca M (ديسمبر 2003). "Regulation of HIV-1 gene expression by histone acetylation and factor recruitment at the LTR promoter". The EMBO Journal. ج. 22 ع. 24: 6550–61. DOI:10.1093/emboj/cdg631. PMC:291826. PMID:14657027.
  • Acín-Pérez R، Bayona-Bafaluy MP، Fernández-Silva P، Moreno-Loshuertos R، Pérez-Martos A، Bruno C، Moraes CT، Enríquez JA (مارس 2004). "Respiratory complex III is required to maintain complex I in mammalian mitochondria". Molecular Cell. ج. 13 ع. 6: 805–15. DOI:10.1016/S1097-2765(04)00124-8. PMC:3164363. PMID:15053874.
  • Zhang R، Poustovoitov MV، Ye X، Santos HA، Chen W، Daganzo SM، Erzberger JP، Serebriiskii IG، Canutescu AA، Dunbrack RL، Pehrson JR، Berger JM، Kaufman PD، Adams PD (يناير 2005). "Formation of MacroH2A-containing senescence-associated heterochromatin foci and senescence driven by ASF1a and HIRA". Developmental Cell. ج. 8 ع. 1: 19–30. DOI:10.1016/j.devcel.2004.10.019. PMID:15621527.
  • Hernández-Muñoz I، Lund AH، van der Stoop P، Boutsma E، Muijrers I، Verhoeven E، Nusinow DA، Panning B، Marahrens Y، van Lohuizen M (مايو 2005). "Stable X chromosome inactivation involves the PRC1 Polycomb complex and requires histone MACROH2A1 and the CULLIN3/SPOP ubiquitin E3 ligase". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 102 ع. 21: 7635–40. DOI:10.1073/pnas.0408918102. PMC:1140410. PMID:15897469.
  • Ioudinkova ES، Barat A، Pichugin A، Markova E، Sklyar I، Pirozhkova I، Robin C، Lipinski M، Ogryzko V، Vassetzky YS، Razin SV (2012). "Distinct distribution of ectopically expressed histone variants H2A.Bbd and MacroH2A in open and closed chromatin domains". PLOS ONE. ج. 7 ع. 10: e47157. DOI:10.1371/journal.pone.0047157. PMC:3484066. PMID:23118866.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
معرفات كيميائية
  • ع
  • ن
  • ت
جينات الكروموسوم 5
جينات الكروموسوم 5
  • أيقونة بوابةبوابة طب
  • أيقونة بوابةبوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
  • أيقونة بوابةبوابة الكيمياء الحيوية
أيقونة بذرة

هذه بذرة مقالة عن جين على كروموسوم 5 بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

التصنيفات الطبية
المعرفات الخارجية