CEBPD

CEBPD
識別號
别名CEBPD；, C/EBP-delta, CELF, CRP3, NF-IL6-beta, CCAAT/enhancer binding protein delta, CCAAT enhancer binding protein delta
外部IDOMIM：116898 MGI：103573 HomoloGene：3808 GeneCards：CEBPD
基因位置（人类）
8號染色體
染色体8號染色體[1]
8號染色體
CEBPD的基因位置
CEBPD的基因位置
基因座8q11.21起始47,736,913 bp[1]
终止47,738,164 bp[1]
基因位置（小鼠）
小鼠16号染色体
染色体小鼠16号染色体[2]
小鼠16号染色体
CEBPD的基因位置
CEBPD的基因位置
基因座16 A2|16 10.09 cM起始15,705,150 bp[2]
终止15,708,895 bp[2]
基因本體
分子功能• DNA结合转录因子活性
• RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
• DNA结合
• sequence-specific DNA binding
• DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
• 血浆蛋白结合
• DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
• protein homodimerization activity
• protein heterodimerization activity
細胞組分• 细胞核
• 核质
生物學過程• regulation of transcription, DNA-templated
• transcription, DNA-templated
• positive regulation of transcription by RNA polymerase II
• transcription by RNA polymerase II
• cytokine-mediated signaling pathway
• hematopoietic progenitor cell differentiation
• regulation of transcription by RNA polymerase II
• fat cell differentiation
• positive regulation of osteoblast differentiation
• negative regulation of transcription, DNA-templated
• 内耳的发生
Sources:Amigo / QuickGO
直系同源
物種人類小鼠
Entrez

1052

12609

Ensembl

ENSG00000221869

ENSMUSG00000071637

UniProt

P49716

Q00322

mRNA​序列

NM_005195

NM_007679

蛋白序列

NP_005186

NP_031705

基因位置​（UCSC）Chr 8: 47.74 – 47.74 MbChr 16: 15.71 – 15.71 Mb
PubMed​查找[3][4]
維基數據
檢視/編輯人類檢視/編輯小鼠

CCAAT/增强子结合蛋白δ，简称C/EBP-δ或CEBPD，是一种在人类中由CEBPD基因编码的蛋白质。[5][6]

功能

由这种无内含子基因编码的蛋白质是一种bZIP转录因子，它可以作为同源二聚体与某些DNA调节区结合。它还可以与相关蛋白C/EBP-α形成异二聚体。编码的蛋白质在调节参与免疫和炎症反应的基因中很重要，并且可能参与调节与巨噬细胞活化和/或分化相关的基因。[7]

CEBPD参与细胞凋亡和细胞增殖的调节。它可能充当肿瘤抑制因子。[8]

一项针对小鼠的研究表明，CEBPD在慢性阻塞性肾病进展过程中可防止肾小管损伤和肾小管间质纤维化的发展。[9]

CEBPD基因的功能可以通过基于独立验证的siRNA敲低来有效检查。[10]

相互作用

CEBPD已被证明能与SMAD3相互作用。[11]

参见

参考文献

  1. ^ 1.0 1.1 1.2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000221869 - Ensembl, May 2017
  2. ^ 2.0 2.1 2.2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000071637 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  4. ^ Mouse PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  5. ^ Cao Z, Umek RM, McKnight SL. Regulated expression of three C/EBP isoforms during adipose conversion of 3T3-L1 cells. Genes & Development. Sep 1991, 5 (9): 1538–52. PMID 1840554. doi:10.1101/gad.5.9.1538 可免费查阅. 
  6. ^ Williams SC, Cantwell CA, Johnson PF. A family of C/EBP-related proteins capable of forming covalently linked leucine zipper dimers in vitro. Genes & Development. Sep 1991, 5 (9): 1553–67. PMID 1884998. doi:10.1101/gad.5.9.1553 可免费查阅. 
  7. ^ Entrez Gene: CEBPD CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), delta. 
  8. ^ Gery S, Tanosaki S, Hofmann WK, Koppel A, Koeffler HP. C/EBPdelta expression in a BCR-ABL-positive cell line induces growth arrest and myeloid differentiation. Oncogene. Feb 2005, 24 (9): 1589–97. PMID 15674331. doi:10.1038/sj.onc.1208393 可免费查阅. 
  9. ^ Duitman J, Borensztajn KS, Pulskens WP, Leemans JC, Florquin S, Spek CA. CCAAT-enhancer binding protein delta (C/EBPδ) attenuates tubular injury and tubulointerstitial fibrogenesis during chronic obstructive nephropathy. Laboratory Investigation; A Journal of Technical Methods and Pathology. Jan 2014, 94 (1): 89–97. PMID 24247561. doi:10.1038/labinvest.2013.127 可免费查阅. 
  10. ^ Munkácsy, Gyöngyi; Sztupinszki, Zsófia; Herman, Péter; Bán, Bence; Pénzváltó, Zsófia; Szarvas, Nóra; Győrffy, Balázs. Validation of RNAi Silencing Efficiency Using Gene Array Data shows 18.5% Failure Rate across 429 Independent Experiments. Molecular Therapy: Nucleic Acids. 2016, 5 (9): e366. ISSN 2162-2531. PMC 5056990 可免费查阅. PMID 27673562. doi:10.1038/mtna.2016.66 （英语）. 
  11. ^ Choy L, Derynck R. Transforming growth factor-beta inhibits adipocyte differentiation by Smad3 interacting with CCAAT/enhancer-binding protein (C/EBP) and repressing C/EBP transactivation function. The Journal of Biological Chemistry. Mar 2003, 278 (11): 9609–19. PMID 12524424. doi:10.1074/jbc.M212259200 可免费查阅. 

阅读

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  • Kinoshita S, Akira S, Kishimoto T. A member of the C/EBP family, NF-IL6 beta, forms a heterodimer and transcriptionally synergizes with NF-IL6. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Feb 1992, 89 (4): 1473–6. Bibcode:1992PNAS...89.1473K. PMC 48473 可免费查阅. PMID 1741402. doi:10.1073/pnas.89.4.1473 可免费查阅. 
  • Nagulapalli S, Pongubala JM, Atchison ML. Multiple proteins physically interact with PU.1. Transcriptional synergy with NF-IL6 beta (C/EBP delta, CRP3). Journal of Immunology. Nov 1995, 155 (9): 4330–8. PMID 7594592. 
  • Wood S, Schertzer M, Yaremko ML. Sequence identity locates CEBPD and FGFR1 to mapped human loci within proximal 8p. Cytogenetics and Cell Genetics. 1995, 70 (3–4): 188–91. PMID 7789168. doi:10.1159/000134030. 
  • Cleutjens CB, van Eekelen CC, van Dekken H, Smit EM, Hagemeijer A, Wagner MJ, Wells DE, Trapman J. The human C/EBP delta (CRP3/CELF) gene: structure and chromosomal localization. Genomics. May 1993, 16 (2): 520–3. PMID 8314590. doi:10.1006/geno.1993.1220. 
  • Chen PL, Riley DJ, Chen Y, Lee WH. Retinoblastoma protein positively regulates terminal adipocyte differentiation through direct interaction with C/EBPs. Genes & Development. Nov 1996, 10 (21): 2794–804. PMID 8946919. doi:10.1101/gad.10.21.2794 可免费查阅. 
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  • Zhu Y, Saunders MA, Yeh H, Deng WG, Wu KK. Dynamic regulation of cyclooxygenase-2 promoter activity by isoforms of CCAAT/enhancer-binding proteins. The Journal of Biological Chemistry. Mar 2002, 277 (9): 6923–8. PMID 11741938. doi:10.1074/jbc.M108075200 可免费查阅. 
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  • Gao H, Parkin S, Johnson PF, Schwartz RC. C/EBP gamma has a stimulatory role on the IL-6 and IL-8 promoters. The Journal of Biological Chemistry. Oct 2002, 277 (41): 38827–37. PMID 12177065. doi:10.1074/jbc.M206224200 可免费查阅. 
  • Dearth LR, DeWille J. Posttranscriptional and posttranslational regulation of C/EBP delta in G0 growth-arrested mammary epithelial cells. The Journal of Biological Chemistry. Mar 2003, 278 (13): 11246–55. PMID 12554732. doi:10.1074/jbc.M207930200 可免费查阅. 
  • Milde-Langosch K, Löning T, Bamberger AM. Expression of the CCAAT/enhancer-binding proteins C/EBPalpha, C/EBPbeta and C/EBPdelta in breast cancer: correlations with clinicopathologic parameters and cell-cycle regulatory proteins. Breast Cancer Research and Treatment. May 2003, 79 (2): 175–85. PMID 12825852. S2CID 45020949. doi:10.1023/A:1023929504884. 
  • Kovács KA, Steinmann M, Magistretti PJ, Halfon O, Cardinaux JR. CCAAT/enhancer-binding protein family members recruit the coactivator CREB-binding protein and trigger its phosphorylation. The Journal of Biological Chemistry. Sep 2003, 278 (38): 36959–65. PMID 12857754. doi:10.1074/jbc.M303147200 可免费查阅. 
  • Chen YW, Hubal MJ, Hoffman EP, Thompson PD, Clarkson PM. Molecular responses of human muscle to eccentric exercise. Journal of Applied Physiology. Dec 2003, 95 (6): 2485–94. PMID 12937035. S2CID 9817319. doi:10.1152/japplphysiol.01161.2002. 
  • Li R, Strohmeyer R, Liang Z, Lue LF, Rogers J. CCAAT/enhancer binding protein delta (C/EBPdelta) expression and elevation in Alzheimer's disease. Neurobiology of Aging. Sep 2004, 25 (8): 991–9. PMID 15212823. S2CID 54232508. doi:10.1016/j.neurobiolaging.2003.10.016. 
  • Sivko GS, Sanford DC, Dearth LD, Tang D, DeWille JW. CCAAT/Enhancer binding protein delta (c/EBPdelta) regulation and expression in human mammary epithelial cells: II. Analysis of activating signal transduction pathways, transcriptional, post-transcriptional, and post-translational control. Journal of Cellular Biochemistry. Nov 2004, 93 (4): 844–56. PMID 15389878. S2CID 31572695. doi:10.1002/jcb.20224. 

外部链接

  • Human CEBPD genome location and CEBPD gene details page in the UCSC Genome Browser（英语：UCSC Genome Browser）.
  • 醫學主題詞表（MeSH）：CEBPD+protein,+human
  • 查
  • 论
  • 编
 
（1） 碱性结构域
（1.1）碱性亮氨酸拉链
（bZIP（英语：bZIP domain））
转录激活因子（英语：Activating transcription factor）（AATF（英语：Apoptosis-antagonizing transcription factor）、1、2、3、4、5、6、7） · AP-1（c-Fos、FOSB、FOSL1、FOSL2、c-Jun、JUNB、JUND） · BACH（1、2） · BATF · BLZF1 ·
C/EBP（α、β、γ、δ、ε、ζ） · CREB（1、3、L1） · CREM · DBP · DDIT3 · GABPA · Gcn4 · HLF · MAF（B、F、G、K） ·
NFE（2、L1、L2、L3） · NFIL3 · NRL · NRF（1、2、3） · XBP1
（1.2）碱性螺旋-环-螺旋
（bHLH）
ATOH1 · AhR · AHRR · ARNT · ASCL1 · BHLHB2 · BMAL（ARNTL、ARNTL2） · CLOCK · EPAS1 · HAND（1、2） · HES（5、6） ·
HEY（1、2、L） · HES1 · HIF（1A、3A） · ID（1、2、3、4） · LYL1 · MXD4 · MYCL1 · MYCN · Neurogenins（1、2、3 ·
肌形成调节因子（英语：Myogenic regulatory factors）（MyoD、成肌蛋白、MYF5、MYF6） · NeuroD（1、2） · NPAS（1、2、3） · OLIG（1、2） · Pho4 ·
Scleraxis · TAL（1、2） · Twist · USF1
（1.3）bHLH-ZIP（英语：Basic helix-loop-helix leucine zipper transcription factors）
AP-4 · MAX · MITF · MNT · MLX · MXI1 · Myc · SREBP（1、2）
（1.4） NF-1
NFI（A、B、C、X） · SMAD（R-SMAD（1、2、3、5、9） - I-SMAD（6、7） - 4）
（1.5） RF-X
RFX（1、2、3、4、5、ANK）
（1.6）碱性螺旋-跨-螺旋（英语：Basic helix-span-helix）
（bHSH）
AP-2（α、β、γ、δ、ε）
 
（2） 锌指结构DNA作用区域
（2.1） 核受体（Cys4）
第一亚族：甲状腺激素受体（α、β）、CAR、FXR、LXR（α、β）、PPAR（α（英语：Peroxisome proliferator-activated receptor alpha）、β/δ、γ）、PXR、RAR（α、β、γ）、ROR（α、β、γ）、
Rev-ErbA（α、β）、VDR
第二亚族（COUP-TF（I、II）、Ear-2（英语：V-erbA-related gene）、HNF4（英语：Hepatocyte nuclear factor 4）（α、γ）、PNR、RXR（α、β、γ）、Testicular receptor（2、4）、TLX）
第三亚族（甾类激素（英语：Steroid hormone receptor）（雄激素、雌激素（α、β）、糖皮质激素、盐皮质激素、孕酮）、雌激素相关（英语：Estrogen related receptor）（α、β、γ））
第四亚族NUR（英语：Nur (biology)）（NGFIB、NOR1、NURR1） · 第五亚族LRH-1、SF1 · 第六亚族GCNF（英语：Germ cell nuclear factor） · 第零亚族DAX1、SHP（英语：Small heterodimer partner）
（2.2） 其他的Cys4结构
GATA（英语：GATA transcription factor）（1、2、3、4、5、6） · MTA（1、2、3） · TRPS1（英语：Tricho-rhino-phalangeal syndrome Type 1）
（2.3） Cys2His2
通用转录因子（TFⅡA、TFⅡB、TFIID、TFⅡE、TFⅡF（1、2）、TFⅡH（1、2、4、2I、3A、3C1、3C2））
ATBF1 · BCL（6、11A、11B） · CTCF · E4F1 · EGR（1、2、3、4） · ERV3 · GFI1 · GLI-Krüppel family（1、2、3、REST、S2、YY1） ·
HIC（1、2） · HIVEP（1、2、3） · IKZF（1、2、3） · ILF（2、3） · Sp/KLF家族（KLF：1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、17，SP：1、2、4、7、8） · MTF1 · MYT1 ·
OSR1 ·  · WT1 · Zbtb7（7A、7B） · ZBTB（16、17、20、32、33、40） · zinc finger（3、7、9、10、19、22、24、33B、
34、35、41、43、44、51、74、143、146、148、165、202、217、219、238、239、259、267、268、281、295、318、330、346、350、365、366、384、
423、451、452、471、593、638、649、655）
（2.4） Cys6
HIVEP1
（2.5）交替composition
AIRE · DIDO1 · GRLF1 · ING（1、2、4） · JARID（1A、1B、1C、1D、2） · JMJD1B
（2.6）WRKY结构
WRKY转录因子家族（英语：WRKY transcription factor family）
 
（3）螺旋-转角-螺旋结构域
ARX（英语：Aristaless related homeobox） · CDX（1、2） · CRX · CUTL1 · DBX（1、2）  · DLX（3、4、5） · EMX2 · EN（1、2） · FHL（1、2、3） · HESX1 · HHEX · HLX · 同源框（A1、A2、A3、A4、A5、A7、A9、A10、A11、A13、B1、B2、B3、B4、B5、B6、B7、B8、B9、B13、C4、C5、C6、C8、C9、C10、C11、C13、D1、D3、D4、D8、D9、D10、D11、
D12、D13） · HOPX · IRX（1、2、3、4、5、6、MKX） · LMX（1A、1B） · MEIS（1、2） · MEOX2 · MNX1 · MSX（1、2） · NANOG · NKX（2-1、2-2、2-3、2-5、3-1、3-2、6-1、6-2） · PBX（1、2、3） · PHF（1、3、6、8、10、16、17、20、21A） · PITX（1、2、3） · POU结构域（PIT-1、BRN-3: A、B、C、八聚体转录因子：1、2、3/4、6、7、11） · OTX（1、2） · PDX1 · ZEB（1、2）
（3.2）配对框
PAX（1、2、3、4、5、6、7、8、9）
（3.3）叉头状/翼状螺旋
E2F（1、2、3、4、5） · FOX proteins（C1、C2、D3、E1、G1、H1、K2、L2、M1、N3、O1、O3、O4、P1、P2、P3）
（3.4）热休克因子（英语：Heat Shock Factor）
HSF（1、2、4）
（3.5）色氨酸簇（英语：Tryptophan clusters）
ELF（2、4、5） · EGF · ELK（1、3、4） · ERF · ERG · ETS（1、2、SPIB） · ETV（1、4、5、6） · FLI1 · Interferon regulatory factors（1、2、3、4、5、6、7、8） · MYB · MYBL2
（3.6）TEA结构域
transcriptional enhancer factor（1、2、3、4）
 
（4） 具有小凹槽触点的β-支架因子
（4.1） Rel homology region（英语：Rel homology domain）
NF-κB（NFKB1、NFKB2、REL、RELA、RELB） · NFAT（C1、C2、C3、C4、5）
（4.2） STAT
STAT（1、2、3、4、5、6）
（4.3） p53样转录因子
p53 p63 p73家族（p53 · p63 · p73） · TBX（1、2、3、5、19、21、22、Brachyury、TBR1）
（4.4） MADS盒
Mef2（A、B、C、D） · SRF
（4.7） 高迁移率族
BBX（英语：BBX (gene)） · HMGB（1（英语：HMGB1）、2（英语：HMGB2）、3（英语：HMGB3）、4（英语：HMGB4）） · HMGN（英语：HMGN）、（1（英语：HMGN1）、2（英语：HMGN2）、3（英语：HMGN3）、4（英语：HMGN4）） · HNF（1A、1B） · SOX（1、2、3、4、5、6、8、9、10、11、12、13、14、15、18、21、SRY） · SSRP1 ·
TCF/LEF家族（TCF（1、3、4） · LEF1) · TOX（1、2、3、4）
（4.9） Grainyhead（英语：Grainyhead）
TFCP2
（4.10） 冷休克域（英语：Cold-shock domain）
CSDA、YBX1
（4.11） Runt
CBF（CBFA2T2、CBFA2T3、RUNX1、RUNX2、RUNX3、RUNX1T1）
 
（0） 其他转录因子
（0.2） HMGI（Y）
HMGA（1、2） · HBP1
（0.3） 袋状结构域
Rb · RBL1（英语：Retinoblastoma-like protein 1） · RBL2（英语：Retinoblastoma-like protein 2）
（0.5） AP-2/EREBP-related factors
Apetala 2 · EREBP（英语：Ethylene-responsive element binding protein） · B3(ARF · ABI3 · RAV)
（0.6） Miscellaneous
ARID（1A、1B、2、3A、3B、4A） · CAP · IFI（16、35） · MLL（2、3、T1） · MNDA · NFY（A、B、C） · ρ因子/σ因子
参见 转录因子/共调节因子缺陷（英语：Template:Transcription factor/coregulator deficiencies）
Category:蛋白质生物合成模板