NEUROD1

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NEUROD1

已知的結構

直系同源搜索: PDBe RCSB

PDBID列表
2QL2

識別號

别名

NEUROD1；, BETA2, BHF-1, MODY6, NEUROD, bHLHa3, neuronal differentiation 1, T2D

外部ID

OMIM：601724 MGI：1339708 HomoloGene：1871 GeneCards：NEUROD1

基因位置（人类）

染色体	2號染色體^[1]

基因座	2q31.3	起始	181,668,295 bp^[1]
基因座	2q31.3	终止	181,680,827 bp^[1]

基因位置（小鼠）

染色体	小鼠2号染色体^[2]

基因座	2 C3\|2 47.58 cM	起始	79,282,865 bp^[2]
基因座	2 C3\|2 47.58 cM	终止	79,287,095 bp^[2]

RNA表达模式

查阅更多表达数据

基因本體
分子功能	• sequence-specific DNA binding • 转录共激活因子活性 • DNA结合 • protein dimerization activity • DNA结合转录因子活性 • DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • 转录因子结合 • chromatin binding • RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • E-box binding • 血浆蛋白结合 • protein heterodimerization activity • double-stranded DNA binding • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
細胞組分	• 細胞質 • 胞內 • 核质 • RNA polymerase II transcription regulator complex • 细胞核
生物學過程	• positive regulation of transcription regulatory region DNA binding • regulation of neuron differentiation • 神经发生 • 细胞分化 • cell fate commitment • regulation of transcription, DNA-templated • pancreatic PP cell fate commitment • glucose homeostasis • regulation of insulin secretion • enteroendocrine cell differentiation • dentate gyrus development • signal transduction involved in regulation of gene expression • neuron development • insulin secretion • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • response to glucose • transcription by RNA polymerase II • embryonic organ morphogenesis • cerebellum development • transcription, DNA-templated • 神經系統的發育 • positive regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • hindbrain development • nucleocytoplasmic transport • positive regulation of neuron differentiation • positive regulation of cell differentiation • nitric oxide mediated signal transduction • positive regulation of apoptotic process • regulation of intestinal epithelial structure maintenance • 内耳的发生 • camera-type eye development • pancreatic A cell fate commitment • amacrine cell differentiation • negative regulation of type B pancreatic cell apoptotic process • cellular response to glucose stimulus • anterior/posterior pattern specification • endocrine pancreas development • positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT
Sources:Amigo / QuickGO

直系同源

物種

人類

小鼠

Entrez


4760


18012

Ensembl


ENSG00000162992


ENSMUSG00000034701

UniProt


Q13562


Q60867

mRNA序列


NM_002500


NM_010894

蛋白序列


NP_002491


NP_035024

基因位置（UCSC）

Chr 2: 181.67 – 181.68 Mb

Chr 2: 79.28 – 79.29 Mb

PubMed查找

^[3]

^[4]

維基數據

檢視/編輯人類

檢視/編輯小鼠

NEUROD1，（小鼠的同源蛋白質記爲NeuroD1）在人體內是NeuroD蛋白家族下的一個轉錄因子，由NEUROD1基因編碼。NEUROD1在神經系統發育中扮演重要角色，於發育中參與調控多種神經系細胞的分化過程^[5]^[6]。

證據表明NEUROD1與II型糖尿病的發生關係密切^[7]。一項研究表明在小鼠大腦內過表達NEUROD1可使神經膠質細胞轉分化爲神經元^[8]。

蛋白质相互作用

已知NEUROD1会和周期蛋白D1^[9]、MAFA^[10]、MAP3K10^[11]发生相互作用。

參考

^ ^1.0 ^1.1 ^1.2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000162992 - Ensembl, May 2017
^ ^2.0 ^2.1 ^2.2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000034701 - Ensembl, May 2017
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^ Mouse PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ Poulin, G; Turgeon, B; Drouin, J. NeuroD1/beta2 contributes to cell-specific transcription of the proopiomelanocortin gene. Molecular and Cellular Biology. 1997-11, 17 (11): 6673–6682 [2021-11-10]. ISSN 0270-7306. PMC 232521 . PMID 9343431. doi:10.1128/MCB.17.11.6673. （原始内容存档于2021-11-10）（英语）.
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^ Ratineau, Christelle; Petry, Mary W.; Mutoh, Hiroyuki; Leiter, Andrew B. Cyclin D1 represses the basic helix-loop-helix transcription factor, BETA2/NeuroD. The Journal of Biological Chemistry. 2002-03-15, 277 (11): 8847–8853 [2021-11-10]. ISSN 0021-9258. PMID 11788592. doi:10.1074/jbc.M110747200. （原始内容存档于2021-11-10）.
^ Zhao, Li; Guo, Min; Matsuoka, Taka-Aki; Hagman, Derek K.; Parazzoli, Susan D.; Poitout, Vincent; Stein, Roland. The islet beta cell-enriched MafA activator is a key regulator of insulin gene transcription. The Journal of Biological Chemistry. 2005-03-25, 280 (12): 11887–11894 [2021-11-10]. ISSN 0021-9258. PMID 15665000. doi:10.1074/jbc.M409475200. （原始内容存档于2022-04-19）.
^ Marcora, E.; Gowan, K.; Lee, J. E. Stimulation of NeuroD activity by huntingtin and huntingtin-associated proteins HAP1 and MLK2. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2003-08-05, 100 (16): 9578–9583. ISSN 0027-8424. PMC 170960 . PMID 12881483. doi:10.1073/pnas.1133382100 （英语）.

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转录因子与细胞内受体

（1）碱性结构域

（1.1）碱性亮氨酸拉链（bZIP（英语：bZIP domain））	转录激活因子（英语：Activating transcription factor）（AATF（英语：Apoptosis-antagonizing transcription factor）、1、2、3、4、5、6、7） · AP-1（c-Fos、FOSB、FOSL1、FOSL2、c-Jun、JUNB、JUND） · BACH（1、2） · BATF · BLZF1 · C/EBP（α、β、γ、δ、ε、ζ） · CREB（1、3、L1） · CREM · DBP · DDIT3 · GABPA · Gcn4 · HLF · MAF（B、F、G、K） · NFE（2、L1、L2、L3） · NFIL3 · NRL · NRF（1、2、3） · XBP1

（1.2）碱性螺旋-环-螺旋（bHLH）	ATOH1 · AhR · AHRR · ARNT · ASCL1 · BHLHB2 · BMAL（ARNTL、ARNTL2） · CLOCK · EPAS1 · HAND（1、2） · HES（5、6） · HEY（1、2、L） · HES1 · HIF（1A、3A） · ID（1、2、3、4） · LYL1 · MXD4 · MYCL1 · MYCN · Neurogenins（1、2、3 · 肌形成调节因子（英语：Myogenic regulatory factors）（MyoD、成肌蛋白、MYF5、MYF6） · NeuroD（1、2） · NPAS（1、2、3） · OLIG（1、2） · Pho4 · Scleraxis · TAL（1、2） · Twist · USF1

（1.3）bHLH-ZIP（英语：Basic helix-loop-helix leucine zipper transcription factors）	AP-4 · MAX · MITF · MNT · MLX · MXI1 · Myc · SREBP（1、2）

（1.4） NF-1	NFI（A、B、C、X） · SMAD（R-SMAD（1、2、3、5、9） - I-SMAD（6、7） - 4）

（1.5） RF-X	RFX（1、2、3、4、5、ANK）

（1.6）碱性螺旋-跨-螺旋（英语：Basic helix-span-helix）（bHSH）	AP-2（α、β、γ、δ、ε）

（2）锌指结构DNA作用区域

（2.1）核受体（Cys₄）	第一亚族：甲状腺激素受体（α、β）、CAR、FXR、LXR（α、β）、PPAR（α（英语：Peroxisome proliferator-activated receptor alpha）、β/δ、γ）、PXR、RAR（α、β、γ）、ROR（α、β、γ）、 Rev-ErbA（α、β）、VDR 第二亚族（COUP-TF（I、II）、Ear-2（英语：V-erbA-related gene）、HNF4（英语：Hepatocyte nuclear factor 4）（α、γ）、PNR、RXR（α、β、γ）、Testicular receptor（2、4）、TLX）第三亚族（甾类激素（英语：Steroid hormone receptor）（雄激素、雌激素（α、β）、糖皮质激素、盐皮质激素、孕酮）、雌激素相关（英语：Estrogen related receptor）（α、β、γ））第四亚族NUR（英语：Nur (biology)）（NGFIB、NOR1、NURR1） · 第五亚族LRH-1、SF1 · 第六亚族GCNF（英语：Germ cell nuclear factor） · 第零亚族DAX1、SHP（英语：Small heterodimer partner）

（2.2）其他的Cys₄结构	GATA（英语：GATA transcription factor）（1、2、3、4、5、6） · MTA（1、2、3） · TRPS1（英语：Tricho-rhino-phalangeal syndrome Type 1）

（2.3） Cys₂His₂	通用转录因子（TFⅡA、TFⅡB、TFIID、TFⅡE、TFⅡF（1、2）、TFⅡH（1、2、4、2I、3A、3C1、3C2）） ATBF1 · BCL（6、11A、11B） · CTCF · E4F1 · EGR（1、2、3、4） · ERV3 · GFI1 · GLI-Krüppel family（1、2、3、REST、S2、YY1） · HIC（1、2） · HIVEP（1、2、3） · IKZF（1、2、3） · ILF（2、3） · Sp/KLF家族（KLF：1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、17，SP：1、2、4、7、8） · MTF1 · MYT1 · OSR1 · · WT1 · Zbtb7（7A、7B） · ZBTB（16、17、20、32、33、40） · zinc finger（3、7、9、10、19、22、24、33B、 34、35、41、43、44、51、74、143、146、148、165、202、217、219、238、239、259、267、268、281、295、318、330、346、350、365、366、384、 423、451、452、471、593、638、649、655）

（2.4） Cys₆	HIVEP1

（2.5）交替composition	AIRE · DIDO1 · GRLF1 · ING（1、2、4） · JARID（1A、1B、1C、1D、2） · JMJD1B

（2.6）WRKY结构	WRKY转录因子家族（英语：WRKY transcription factor family）

（3）螺旋-转角-螺旋结构域

（3.1）同源异型域	ARX（英语：Aristaless related homeobox） · CDX（1、2） · CRX · CUTL1 · DBX（1、2） · DLX（3、4、5） · EMX2 · EN（1、2） · FHL（1、2、3） · HESX1 · HHEX · HLX · 同源框（A1、A2、A3、A4、A5、A7、A9、A10、A11、A13、B1、B2、B3、B4、B5、B6、B7、B8、B9、B13、C4、C5、C6、C8、C9、C10、C11、C13、D1、D3、D4、D8、D9、D10、D11、 D12、D13） · HOPX · IRX（1、2、3、4、5、6、MKX） · LMX（1A、1B） · MEIS（1、2） · MEOX2 · MNX1 · MSX（1、2） · NANOG · NKX（2-1、2-2、2-3、2-5、3-1、3-2、6-1、6-2） · PBX（1、2、3） · PHF（1、3、6、8、10、16、17、20、21A） · PITX（1、2、3） · POU结构域（PIT-1、BRN-3: A、B、C、八聚体转录因子：1、2、3/4、6、7、11） · OTX（1、2） · PDX1 · ZEB（1、2）

（3.2）配对框	PAX（1、2、3、4、5、6、7、8、9）

（3.3）叉头状/翼状螺旋	E2F（1、2、3、4、5） · FOX proteins（C1、C2、D3、E1、G1、H1、K2、L2、M1、N3、O1、O3、O4、P1、P2、P3）

（3.4）热休克因子（英语：Heat Shock Factor）	HSF（1、2、4）

（3.5）色氨酸簇（英语：Tryptophan clusters）	ELF（2、4、5） · EGF · ELK（1、3、4） · ERF · ERG · ETS（1、2、SPIB） · ETV（1、4、5、6） · FLI1 · Interferon regulatory factors（1、2、3、4、5、6、7、8） · MYB · MYBL2

（3.6）TEA结构域	transcriptional enhancer factor（1、2、3、4）

（4）具有小凹槽触点的β-支架因子

（4.1） Rel homology region（英语：Rel homology domain）	NF-κB（NFKB1、NFKB2、REL、RELA、RELB） · NFAT（C1、C2、C3、C4、5）

（4.2） STAT	STAT（1、2、3、4、5、6）

（4.3） p53样转录因子	p53 p63 p73家族（p53 · p63 · p73） · TBX（1、2、3、5、19、21、22、Brachyury、TBR1）

（4.4） MADS盒	Mef2（A、B、C、D） · SRF

（4.6） TATA结合蛋白	TATA结合蛋白 · TBPL1

（4.7）高迁移率族	BBX（英语：BBX (gene)） · HMGB（1（英语：HMGB1）、2（英语：HMGB2）、3（英语：HMGB3）、4（英语：HMGB4）） · HMGN（英语：HMGN）、（1（英语：HMGN1）、2（英语：HMGN2）、3（英语：HMGN3）、4（英语：HMGN4）） · HNF（1A、1B） · SOX（1、2、3、4、5、6、8、9、10、11、12、13、14、15、18、21、SRY） · SSRP1 · TCF/LEF家族（TCF（1、3、4） · LEF1) · TOX（1、2、3、4）

（4.9） Grainyhead（英语：Grainyhead）	TFCP2

（4.10）冷休克域（英语：Cold-shock domain）	CSDA、YBX1

（4.11） Runt	CBF（CBFA2T2、CBFA2T3、RUNX1、RUNX2、RUNX3、RUNX1T1）

（0）其他转录因子

（0.2） HMGI（Y）	HMGA（1、2） · HBP1

（0.3）袋状结构域	Rb · RBL1（英语：Retinoblastoma-like protein 1） · RBL2（英语：Retinoblastoma-like protein 2）

（0.5） AP-2/EREBP-related factors	Apetala 2 · EREBP（英语：Ethylene-responsive element binding protein） · B3(ARF · ABI3 · RAV)

（0.6） Miscellaneous	ARID（1A、1B、2、3A、3B、4A） · CAP · IFI（16、35） · MLL（2、3、T1） · MNDA · NFY（A、B、C） · ρ因子/σ因子