BEST2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | BEST2, VMD2L1, bestrophin 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607335 MGI: 2387588 HomoloGene: 41187 GeneCards: BEST2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • chloride channel activity • молекулярна функція |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • клітинна мембрана • війка • мембрана • chloride channel complex |
---|
Біологічний процес | • sensory perception of smell • membrane depolarization • chloride transport • ion transport • chloride transmembrane transport • GO:0022610 життєдіяльність |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/6f/PBB_GE_BEST2_207432_at_fs.png/250px-PBB_GE_BEST2_207432_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 12.75 – 12.76 Mb | Хр. 8: 85.73 – 85.74 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
BEST2 (англ. Bestrophin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 509 амінокислот, а молекулярна маса — 57 139[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTVTYTARVA | | NARFGGFSQL | | LLLWRGSIYK | | LLWRELLCFL | | GFYMALSAAY |
RFVLTEGQKR | | YFEKLVIYCD | | QYASLIPVSF | | VLGFYVTLVV | | NRWWSQYLCM |
PLPDALMCVV | | AGTVHGRDDR | | GRLYRRTLMR | | YAGLSAVLIL | | RSVSTAVFKR |
FPTIDHVVEA | | GFMTREERKK | | FENLNSSYNK | | YWVPCVWFSN | | LAAQARREGR |
IRDNSALKLL | | LEELNVFRGK | | CGMLFHYDWI | | SVPLVYTQVV | | TIALYSYFLA |
CLIGRQFLDP | | AQGYKDHDLD | | LCVPIFTLLQ | | FFFYAGWLKV | | AEQLINPFGE |
DDDDFETNFL | | IDRNFQVSML | | AVDEMYDDLA | | VLEKDLYWDA | | AEARAPYTAA |
TVFQLRQPSF | | QGSTFDITLA | | KEDMQFQRLD | | GLDGPMGEAP | | GDFLQRLLPA |
GAGMVAGGPL | | GRRLSFLLRK | | NSCVSEASTG | | ASCSCAVVPE | | GAAPECSCGD |
PLLDPGLPEP | | EAPPPAGPEP | | LTLIPGPVEP | | FSIVTMPGPR | | GPAPPWLPSP |
IGEEEENLA |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, хлорних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Stoehr H., Marquardt A., Nanda I., Schmid M., Weber B.H.F. (2002). Three novel human VMD2-like genes are members of the evolutionary highly conserved RFP-TM family. Eur. J. Hum. Genet. 10: 281—284. PMID 12032738 DOI:10.1038/sj.ejhg.5200796
- Sun H., Tsunenari T., Yau K.-W., Nathans J. (2002). The vitelliform macular dystrophy protein defines a new family of chloride channels. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 4008—4013. PMID 11904445 DOI:10.1073/pnas.052692999
- Qu Z., Hartzell H.C. (2008). Bestrophin Cl- channels are highly permeable to HCO3-. Am. J. Physiol. 294: C1371—C1377. PMID 18400985 DOI:10.1152/ajpcell.00398.2007
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17107 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8NFU1 (англ.) . Архів оригіналу за 21 листопада 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
| |
---|
| Ліганд-залежні | |
---|
| Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
| | |
---|
| постійно відчинені | |
---|
| Протончутливі | |
---|
| Потенціалкеровані | |
---|
|
| | K+: Калієві канали |
---|
| Кальцій-активовані | |
---|
| Вхідного випрямлення | |
---|
| Двопородоменні | |
---|
| Потенціалкеровані | |
---|
|
| | | | |
|