BEST2

Ідентифікатори

Символи

BEST2, VMD2L1, bestrophin 2

Зовнішні ІД

OMIM: 607335 MGI: 2387588 HomoloGene: 41187 GeneCards: BEST2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• chloride channel activity • молекулярна функція
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • війка • мембрана • chloride channel complex
Біологічний процес	• sensory perception of smell • membrane depolarization • chloride transport • ion transport • chloride transmembrane transport • GO:0022610 життєдіяльність
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


54831


212989

Ensembl


ENSG00000039987


ENSMUSG00000052819

UniProt


Q8NFU1


Q8BGM5

RefSeq (мРНК)


NM_017682


NM_001130194

RefSeq (білок)


NP_060152


NP_001123666

Локус (UCSC)

Хр. 19: 12.75 – 12.76 Mb

Хр. 8: 85.73 – 85.74 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

BEST2 (англ. Bestrophin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 509 амінокислот, а молекулярна маса — 57 139^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTVTYTARVA	NARFGGFSQL	LLLWRGSIYK	LLWRELLCFL	GFYMALSAAY
RFVLTEGQKR	YFEKLVIYCD	QYASLIPVSF	VLGFYVTLVV	NRWWSQYLCM
PLPDALMCVV	AGTVHGRDDR	GRLYRRTLMR	YAGLSAVLIL	RSVSTAVFKR
FPTIDHVVEA	GFMTREERKK	FENLNSSYNK	YWVPCVWFSN	LAAQARREGR
IRDNSALKLL	LEELNVFRGK	CGMLFHYDWI	SVPLVYTQVV	TIALYSYFLA
CLIGRQFLDP	AQGYKDHDLD	LCVPIFTLLQ	FFFYAGWLKV	AEQLINPFGE
DDDDFETNFL	IDRNFQVSML	AVDEMYDDLA	VLEKDLYWDA	AEARAPYTAA
TVFQLRQPSF	QGSTFDITLA	KEDMQFQRLD	GLDGPMGEAP	GDFLQRLLPA
GAGMVAGGPL	GRRLSFLLRK	NSCVSEASTG	ASCSCAVVPE	GAAPECSCGD
PLLDPGLPEP	EAPPPAGPEP	LTLIPGPVEP	FSIVTMPGPR	GPAPPWLPSP
IGEEEENLA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, хлорних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Stoehr H., Marquardt A., Nanda I., Schmid M., Weber B.H.F. (2002). Three novel human VMD2-like genes are members of the evolutionary highly conserved RFP-TM family. Eur. J. Hum. Genet. 10: 281—284. PMID 12032738 DOI:10.1038/sj.ejhg.5200796
Sun H., Tsunenari T., Yau K.-W., Nathans J. (2002). The vitelliform macular dystrophy protein defines a new family of chloride channels. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 4008—4013. PMID 11904445 DOI:10.1073/pnas.052692999
Qu Z., Hartzell H.C. (2008). Bestrophin Cl- channels are highly permeable to HCO3-. Am. J. Physiol. 294: C1371—C1377. PMID 18400985 DOI:10.1152/ajpcell.00398.2007

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17107 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8NFU1 (англ.) . Архів оригіналу за 21 листопада 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані