TRPA1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3J9P

Ідентифікатори

Символи

TRPA1, ANKTM1, FEPS, transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, FEPS1

Зовнішні ІД

OMIM: 604775 MGI: 3522699 HomoloGene: 7189 GeneCards: TRPA1

Реагує на сполуку

hexamethylene diisocyanate, Етаналь, апоморфін, auranofin, 1,4-Бензохінон, benzyl bromide, Бромоацетон, CS (іритант), Хлоропікрин, Дибензоксазепін, Дибутилфталат, methylglyoxal, methyl isocyanate, oleocanthal, хлорацетофенон, озон, Тимол, Акролеїн, Аліцин, тетрагідроканнабінол, URB597, ментол^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• channel activity • calcium-release channel activity • ion channel activity • temperature-gated cation channel activity • calcium channel activity • identical protein binding
Клітинна компонента	• stereocilium bundle • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane
Біологічний процес	• GO:1904578 response to organic cyclic compound • detection of chemical stimulus involved in sensory perception of pain • відповідь на стимул • ion transport • response to organic substance • cell surface receptor signaling pathway • response to pain • calcium ion transmembrane transport • response to cold • sensory perception of pain • protein homotetramerization • response to hydrogen peroxide • thermoception • calcium ion transport • detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of pain • release of sequestered calcium ion into cytosol • трансмембранний транспорт • ion transmembrane transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8989


277328

Ensembl


ENSG00000104321


ENSMUSG00000032769

UniProt


O75762


Q8BLA8

RefSeq (мРНК)


NM_007332


NM_177781 NM_001348288

RefSeq (білок)


NP_015628


NP_808449 NP_001335217

Локус (UCSC)

Хр. 8: 72.02 – 72.08 Mb

Хр. 1: 14.94 – 14.99 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRPA1 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 119 амінокислот, а молекулярна маса — 127 501^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKRSLRKMWR	PGEKKEPQGV	VYEDVPDDTE	DFKESLKVVF	EGSAYGLQNF
NKQKKLKRCD	DMDTFFLHYA	AAEGQIELME	KITRDSSLEV	LHEMDDYGNT
PLHCAVEKNQ	IESVKFLLSR	GANPNLRNFN	MMAPLHIAVQ	GMNNEVMKVL
LEHRTIDVNL	EGENGNTAVI	IACTTNNSEA	LQILLKKGAK	PCKSNKWGCF
PIHQAAFSGS	KECMEIILRF	GEEHGYSRQL	HINFMNNGKA	TPLHLAVQNG
DLEMIKMCLD	NGAQIDPVEK	GRCTAIHFAA	TQGATEIVKL	MISSYSGSVD
IVNTTDGCHE	TMLHRASLFD	HHELADYLIS	VGADINKIDS	EGRSPLILAT
ASASWNIVNL	LLSKGAQVDI	KDNFGRNFLH	LTVQQPYGLK	NLRPEFMQMQ
QIKELVMDED	NDGCTPLHYA	CRQGGPGSVN	NLLGFNVSIH	SKSKDKKSPL
HFAASYGRIN	TCQRLLQDIS	DTRLLNEGDL	HGMTPLHLAA	KNGHDKVVQL
LLKKGALFLS	DHNGWTALHH	ASMGGYTQTM	KVILDTNLKC	TDRLDEDGNT
ALHFAAREGH	AKAVALLLSH	NADIVLNKQQ	ASFLHLALHN	KRKEVVLTII
RSKRWDECLK	IFSHNSPGNK	CPITEMIEYL	PECMKVLLDF	CMLHSTEDKS
CRDYYIEYNF	KYLQCPLEFT	KKTPTQDVIY	EPLTALNAMV	QNNRIELLNH
PVCKEYLLMK	WLAYGFRAHM	MNLGSYCLGL	IPMTILVVNI	KPGMAFNSTG
IINETSDHSE	ILDTTNSYLI	KTCMILVFLS	SIFGYCKEAG	QIFQQKRNYF
MDISNVLEWI	IYTTGIIFVL	PLFVEIPAHL	QWQCGAIAVY	FYWMNFLLYL
QRFENCGIFI	VMLEVILKTL	LRSTVVFIFL	LLAFGLSFYI	LLNLQDPFSS
PLLSIIQTFS	MMLGDINYRE	SFLEPYLRNE	LAHPVLSFAQ	LVSFTIFVPI
VLMNLLIGLA	VGDIAEVQKH	ASLKRIAMQV	ELHTSLEKKL	PLWFLRKVDQ
KSTIVYPNKP	RSGGMLFHIF	CFLFCTGEIR	QEIPNADKSL	EMEILKQKYR
LKDLTFLLEK	QHELIKLIIQ	KMEIISETED	DDSHCSFQDR	FKKEQMEQRN
SRWNTVLRAV	KAKTHHLEP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Jaquemar D., Schenker T., Trueb B. (1999). An ankyrin-like protein with transmembrane domains is specifically lost after oncogenic transformation of human fibroblasts. J. Biol. Chem. 274: 7325—7333. PMID 10066796 DOI:10.1074/jbc.274.11.7325
Paulsen C.E., Armache J.P., Gao Y., Cheng Y., Julius D. (2015). Structure of the TRPA1 ion channel suggests regulatory mechanisms. Nature. 520: 511—517. PMID 25855297 DOI:10.1038/nature14367

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:497 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
↑ UniProt, O75762 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 8

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані