KCNN2 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/8e/Protein_KCNN2_PDB_1g4y.png/250px-Protein_KCNN2_PDB_1g4y.png) |
Ідентифікатори |
---|
Символи | KCNN2, KCa2.2, SK2, SKCA2, SKCa 2, hSK2, potassium calcium-activated channel subfamily N member 2, DYT34, NEDMAB |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605879 HomoloGene: 23150 GeneCards: KCNN2 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
tetraethylammonium, tubocurarine[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein homodimerization activity • protein domain specific binding • calcium-activated potassium channel activity • calmodulin binding • alpha-actinin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • small conductance calcium-activated potassium channel activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • cell surface • neuronal cell body • клітинна мембрана • Z discdkac • dendritic spine • neuron projection |
---|
Біологічний процес | • ion transport • potassium ion transport • regulation of potassium ion transmembrane transport • potassium ion transmembrane transport • membrane repolarization during atrial cardiac muscle cell action potential |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/0e/PBB_GE_KCNN2_220116_at_fs.png/250px-PBB_GE_KCNN2_220116_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001278204 NM_021614 NM_170775 NM_001372233 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001265133 NP_067627 NP_740721 NP_001359162 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 114.06 – 114.5 Mb | н/д |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
KCNN2 (англ. Potassium calcium-activated channel subfamily N member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 579 амінокислот, а молекулярна маса — 63 760[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSSCRYNGGV | | MRPLSNLSAS | | RRNLHEMDSE | | AQPLQPPASV | | GGGGGASSPS |
AAAAAAAAVS | | SSAPEIVVSK | | PEHNNSNNLA | | LYGTGGGGST | | GGGGGGGGSG |
HGSSSGTKSS | | KKKNQNIGYK | | LGHRRALFEK | | RKRLSDYALI | | FGMFGIVVMV |
IETELSWGAY | | DKASLYSLAL | | KCLISLSTII | | LLGLIIVYHA | | REIQLFMVDN |
GADDWRIAMT | | YERIFFICLE | | ILVCAIHPIP | | GNYTFTWTAR | | LAFSYAPSTT |
TADVDIILSI | | PMFLRLYLIA | | RVMLLHSKLF | | TDASSRSIGA | | LNKINFNTRF |
VMKTLMTICP | | GTVLLVFSIS | | LWIIAAWTVR | | ACERYHDQQD | | VTSNFLGAMW |
LISITFLSIG | | YGDMVPNTYC | | GKGVCLLTGI | | MGAGCTALVV | | AVVARKLELT |
KAEKHVHNFM | | MDTQLTKRVK | | NAAANVLRET | | WLIYKNTKLV | | KKIDHAKVRK |
HQRKFLQAIH | | QLRSVKMEQR | | KLNDQANTLV | | DLAKTQNIMY | | DMISDLNERS |
EDFEKRIVTL | | ETKLETLIGS | | IHALPGLISQ | | TIRQQQRDFI | | EAQMESYDKH |
VTYNAERSRS | | SSRRRRSSST | | APPTSSESS |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну. Локалізований у мембрані.
Література
- Desai R., Peretz A., Idelson H., Lazarovici P., Attali B. (2000). Ca2+-activated K+ channels in human leukemic Jurkat T cells. Molecular cloning, biochemical and functional characterization. J. Biol. Chem. 275: 39954—39963. PMID 10991935 DOI:10.1074/jbc.M001562200
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6291 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2016. Процитовано 31 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9H2S1 (англ.) . Архів оригіналу за 28 жовтня 2016. Процитовано 31 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
| |
---|
| Ліганд-залежні | |
---|
| Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
| | |
---|
| постійно відчинені | |
---|
| Протончутливі | |
---|
| Потенціалкеровані | |
---|
|
| | K+: Калієві канали |
---|
| Кальцій-активовані | |
---|
| Вхідного випрямлення | |
---|
| Двопородоменні | |
---|
| Потенціалкеровані | |
---|
|
| | | | |
|