TRPC4

Ідентифікатори

Символи

TRPC4, HTRP-4, HTRP4, TRP4, transient receptor potential cation channel subfamily C member 4

Зовнішні ІД

OMIM: 603651 MGI: 109525 HomoloGene: 22955 GeneCards: TRPC4

Пов'язані генетичні захворювання

ожиріння^[1]

Реагує на сполуку

2-aminoethoxydiphenylborate^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• beta-catenin binding • store-operated calcium channel activity • cadherin binding • inositol 1,4,5 trisphosphate binding • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium channel activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • Кальцієві канали • мембрана • cell-cell junction • cortical cytoskeleton • клітинна мембрана • cell surface • basolateral plasma membrane • caveola • membrane raft • integral component of plasma membrane • GO:0009327 protein-containing complex • cation channel complex
Біологічний процес	• regulation of cytosolic calcium ion concentration • calcium ion import • oligodendrocyte differentiation • ion transport • calcium ion transmembrane transport • manganese ion transport • gamma-aminobutyric acid secretion • calcium ion transport • трансмембранний транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7223


22066

Ensembl


ENSG00000133107


ENSMUSG00000027748

UniProt


Q9UBN4


Q9QUQ5

RefSeq (мРНК)

NM_001135955 NM_001135956 NM_001135957 NM_001135958 NM_003306
NM_016179 NM_001354799 NM_001354806 NM_001372055


NM_001253682 NM_001253683 NM_016984

RefSeq (білок)

NP_001129427 NP_001129428 NP_001129429 NP_001129430 NP_003297
NP_057263 NP_001341728 NP_001341735 NP_001358984


NP_001240611 NP_001240612 NP_058680

Локус (UCSC)

Хр. 13: 37.63 – 37.87 Mb

Хр. 3: 54.06 – 54.23 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRPC4 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily C member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 977 амінокислот, а молекулярна маса — 112 101^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQFYYKRNV	NAPYRDRIPL	RIVRAESELS	PSEKAYLNAV	EKGDYASVKK
SLEEAEIYFK	ININCIDPLG	RTALLIAIEN	ENLELIELLL	SFNVYVGDAL
LHAIRKEVVG	AVELLLNHKK	PSGEKQVPPI	LLDKQFSEFT	PDITPIILAA
HTNNYEIIKL	LVQKGVSVPR	PHEVRCNCVE	CVSSSDVDSL	RHSRSRLNIY
KALASPSLIA	LSSEDPFLTA	FQLSWELQEL	SKVENEFKSE	YEELSRQCKQ
FAKDLLDQTR	SSRELEIILN	YRDDNSLIEE	QSGNDLARLK	LAIKYRQKEF
VAQPNCQQLL	ASRWYDEFPG	WRRRHWAVKM	VTCFIIGLLF	PVFSVCYLIA
PKSPLGLFIR	KPFIKFICHT	ASYLTFLFLL	LLASQHIDRS	DLNRQGPPPT
IVEWMILPWV	LGFIWGEIKQ	MWDGGLQDYI	HDWWNLMDFV	MNSLYLATIS
LKIVAFVKYS	ALNPRESWDM	WHPTLVAEAL	FAIANIFSSL	RLISLFTANS
HLGPLQISLG	RMLLDILKFL	FIYCLVLLAF	ANGLNQLYFY	YEETKGLTCK
GIRCEKQNNA	FSTLFETLQS	LFWSIFGLIN	LYVTNVKAQH	EFTEFVGATM
FGTYNVISLV	VLLNMLIAMM	NNSYQLIADH	ADIEWKFART	KLWMSYFEEG
GTLPTPFNVI	PSPKSLWYLI	KWIWTHLCKK	KMRRKPESFG	TIGRRAADNL
RRHHQYQEVM	RNLVKRYVAA	MIRDAKTEEG	LTEENFKELK	QDISSFRFEV
LGLLRGSKLS	TIQSANASKE	SSNSADSDEK	SDSEGNSKDK	KKNFSLFDLT
TLIHPRSAAI	ASERHNISNG	SALVVQEPPR	EKQRKVNFVT	DIKNFGLFHR
RSKQNAAEQN	ANQIFSVSEE	VARQQAAGPL	ERNIQLESRG	LASRGDLSIP
GLSEQCVLVD	HRERNTDTLG	LQVGKRVCPF	KSEKVVVEDT	VPIIPKEKHA
KEEDSSIDYD	LNLPDTVTHE	DYVTTRL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Mery L., Magnino F., Schmidt K., Krause K.-H., Dufour J.-F. (2001). Alternative splice variants of hTrp4 differentially interact with the C-terminal portion of the inositol 1,4,5-trisphosphate receptors. FEBS Lett. 487: 377—383. PMID 11163362 DOI:10.1016/S0014-5793(00)02362-0
Schaefer M., Plant T.D., Stresow N., Albrecht N., Schultz G. (2002). Functional differences between TRPC4 splice variants. J. Biol. Chem. 277: 3752—3759. PMID 11713258 DOI:10.1074/jbc.M109850200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hofmann T., Schaefer M., Schultz G., Gudermann T. (2002). Subunit composition of mammalian transient receptor potential channels in living cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 7461—7466. PMID 12032305 DOI:10.1073/pnas.102596199
Odell A.F., Scott J.L., Van Helden D.F. (2005). Epidermal growth factor induces tyrosine phosphorylation, membrane insertion, and activation of transient receptor potential channel 4. J. Biol. Chem. 280: 37974—37987. PMID 16144838 DOI:10.1074/jbc.M503646200
Lussier M.P., Lepage P.K., Bousquet S.M., Boulay G. (2008). RNF24, a new TRPC interacting protein, causes the intracellular retention of TRPC. Cell Calcium. 43: 432—443. PMID 17850865 DOI:10.1016/j.ceca.2007.07.009

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TRPC4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12336 (англ.) . Архів оригіналу за 18 квітня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UBN4 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 13

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані