ITPR1

ITPR1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1N4K, 1XZZ

Ідентифікатори
Символи ITPR1, ACV, CLA4, INSP3R1, IP3R, IP3R1, PPP1R94, SCA15, SCA16, SCA29, inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1
Зовнішні ІД OMIM: 147265 MGI: 96623 HomoloGene: 1673 GeneCards: ITPR1
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння, spinocerebellar ataxia type 15/16, spinocerebellar ataxia type 29, Gillespie syndrome[1]
Реагує на сполуку
adenophostin A, Аденозинтрифосфат, кофеїн[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

calcium channel inhibitor activity
calcium channel activity
inositol 1,4,5-trisphosphate-sensitive calcium-release channel activity
calcium ion transmembrane transporter activity
ion channel activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
phosphatidylinositol binding
calcium-release channel activity
calcium ion binding
inositol 1,4,5 trisphosphate binding
inositol 1,4,5-trisphosphate receptor activity involved in regulation of postsynaptic cytosolic calcium levels

Клітинна компонента

цитоплазма
integral component of membrane
platelet dense tubular network
endoplasmic reticulum membrane
мембрана
GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення
nuclear envelope
calcineurin complex
sarcoplasmic reticulum
nuclear inner membrane
platelet dense granule membrane
ядерце
platelet dense tubular network membrane
клітинна мембрана
transport vesicle membrane
GO:0016023 cytoplasmic vesicle
perinuclear region of cytoplasm
ендоплазматичний ретикулум
cytoplasmic vesicle membrane
secretory granule membrane
GO:0009327 protein-containing complex
Schaffer collateral - CA1 synapse

Біологічний процес

release of sequestered calcium ion into cytosol
regulation of cardiac conduction
response to hypoxia
voluntary musculoskeletal movement
regulation of insulin secretion
epithelial fluid transport
ion transport
post-embryonic development
endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis
platelet activation
intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress
regulation of autophagy
трансмембранний транспорт
calcium ion transmembrane transport
negative regulation of calcium-mediated signaling
inositol phosphate-mediated signaling
calcium ion transport
GO:0097285 апоптоз
GO:0072468 сигнальна трансдукція
regulation of molecular function
GO:0015915 транспорт
regulation of postsynaptic cytosolic calcium ion concentration

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3708
16438
Ensembl
ENSG00000150995
ENSMUSG00000030102
UniProt
Q14643
P11881
RefSeq (мРНК)
NM_001099952
NM_001168272
NM_002222
NM_001378452
NM_010585
RefSeq (білок)
NP_001093422
NP_001161744
NP_002213
NP_034715
Локус (UCSC) Хр. 3: 4.49 – 4.85 Mb Хр. 6: 108.19 – 108.53 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ITPR1 (англ. Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 758 амінокислот, а молекулярна маса — 313 929[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSDKMSSFLHIGDICSLYAEGSTNGFISTLGLVDDRCVVQPETGDLNNPP
KKFRDCLFKLCPMNRYSAQKQFWKAAKPGANSTTDAVLLNKLHHAADLEK
KQNETENRKLLGTVIQYGNVIQLLHLKSNKYLTVNKRLPALLEKNAMRVT
LDEAGNEGSWFYIQPFYKLRSIGDSVVIGDKVVLNPVNAGQPLHASSHQL
VDNPGCNEVNSVNCNTSWKIVLFMKWSDNKDDILKGGDVVRLFHAEQEKF
LTCDEHRKKQHVFLRTTGRQSATSATSSKALWEVEVVQHDPCRGGAGYWN
SLFRFKHLATGHYLAAEVDPDFEEECLEFQPSVDPDQDASRSRLRNAQEK
MVYSLVSVPEGNDISSIFELDPTTLRGGDSLVPRNSYVRLRHLCTNTWVH
STNIPIDKEEEKPVMLKIGTSPVKEDKEAFAIVPVSPAEVRDLDFANDAS
KVLGSIAGKLEKGTITQNERRSVTKLLEDLVYFVTGGTNSGQDVLEVVFS
KPNRERQKLMREQNILKQIFKLLQAPFTDCGDGPMLRLEELGDQRHAPFR
HICRLCYRVLRHSQQDYRKNQEYIAKQFGFMQKQIGYDVLAEDTITALLH
NNRKLLEKHITAAEIDTFVSLVRKNREPRFLDYLSDLCVSMNKSIPVTQE
LICKAVLNPTNADILIETKLVLSRFEFEGVSSTGENALEAGEDEEEVWLF
WRDSNKEIRSKSVRELAQDAKEGQKEDRDVLSYYRYQLNLFARMCLDRQY
LAINEISGQLDVDLILRCMSDENLPYDLRASFCRLMLHMHVDRDPQEQVT
PVKYARLWSEIPSEIAIDDYDSSGASKDEIKERFAQTMEFVEEYLRDVVC
QRFPFSDKEKNKLTFEVVNLARNLIYFGFYNFSDLLRLTKILLAILDCVH
VTTIFPISKMAKGEENKGNNDVEKLKSSNVMRSIHGVGELMTQVVLRGGG
FLPMTPMAAAPEGNVKQAEPEKEDIMVMDTKLKIIEILQFILNVRLDYRI
SCLLCIFKREFDESNSQTSETSSGNSSQEGPSNVPGALDFEHIEEQAEGI
FGGSEENTPLDLDDHGGRTFLRVLLHLTMHDYPPLVSGALQLLFRHFSQR
QEVLQAFKQVQLLVTSQDVDNYKQIKQDLDQLRSIVEKSELWVYKGQGPD
ETMDGASGENEHKKTEEGNNKPQKHESTSSYNYRVVKEILIRLSKLCVQE
SASVRKSRKQQQRLLRNMGAHAVVLELLQIPYEKAEDTKMQEIMRLAHEF
LQNFCAGNQQNQALLHKHINLFLNPGILEAVTMQHIFMNNFQLCSEINER
VVQHFVHCIETHGRNVQYIKFLQTIVKAEGKFIKKCQDMVMAELVNSGED
VLVFYNDRASFQTLIQMMRSERDRMDENSPLMYHIHLVELLAVCTEGKNV
YTEIKCNSLLPLDDIVRVVTHEDCIPEVKIAYINFLNHCYVDTEVEMKEI
YTSNHMWKLFENFLVDICRACNNTSDRKHADSILEKYVTEIVMSIVTTFF
SSPFSDQSTTLQTRQPVFVQLLQGVFRVYHCNWLMPSQKASVESCIRVLS
DVAKSRAIAIPVDLDSQVNNLFLKSHSIVQKTAMNWRLSARNAARRDSVL
AASRDYRNIIERLQDIVSALEDRLRPLVQAELSVLVDVLHRPELLFPENT
DARRKCESGGFICKLIKHTKQLLEENEEKLCIKVLQTLREMMTKDRGYGE
KLISIDELDNAELPPAPDSENATEELEPSPPLRQLEDHKRGEALRQVLVN
RYYGNVRPSGRRESLTSFGNGPLSAGGPGKPGGGGGGSGSSSMSRGEMSL
AEVQCHLDKEGASNLVIDLIMNASSDRVFHESILLAIALLEGGNTTIQHS
FFCRLTEDKKSEKFFKVFYDRMKVAQQEIKATVTVNTSDLGNKKKDDEVD
RDAPSRKKAKEPTTQITEEVRDQLLEASAATRKAFTTFRREADPDDHYQP
GEGTQATADKAKDDLEMSAVITIMQPILRFLQLLCENHNRDLQNFLRCQN
NKTNYNLVCETLQFLDCICGSTTGGLGLLGLYINEKNVALINQTLESLTE
YCQGPCHENQNCIATHESNGIDIITALILNDINPLGKKRMDLVLELKNNA
SKLLLAIMESRHDSENAERILYNMRPKELVEVIKKAYMQGEVEFEDGENG
EDGAASPRNVGHNIYILAHQLARHNKELQSMLKPGGQVDGDEALEFYAKH
TAQIEIVRLDRTMEQIVFPVPSICEFLTKESKLRIYYTTERDEQGSKIND
FFLRSEDLFNEMNWQKKLRAQPVLYWCARNMSFWSSISFNLAVLMNLLVA
FFYPFKGVRGGTLEPHWSGLLWTAMLISLAIVIALPKPHGIRALIASTIL
RLIFSVGLQPTLFLLGAFNVCNKIIFLMSFVGNCGTFTRGYRAMVLDVEF
LYHLLYLVICAMGLFVHEFFYSLLLFDLVYREETLLNVIKSVTRNGRSII
LTAVLALILVYLFSIVGYLFFKDDFILEVDRLPNETAVPETGESLASEFL
FSDVCRVESGENCSSPAPREELVPAEETEQDKEHTCETLLMCIVTVLSHG
LRSGGGVGDVLRKPSKEEPLFAARVIYDLLFFFMVIIIVLNLIFGVIIDT
FADLRSEKQKKEEILKTTCFICGLERDKFDNKTVTFEEHIKEEHNMWHYL
CFIVLVKVKDSTEYTGPESYVAEMIKERNLDWFPRMRAMSLVSSDSEGEQ
NELRNLQEKLESTMKLVTNLSGQLSELKDQMTEQRKQKQRIGLLGHPPHM
NVNPQQPA

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах.

Література

  • Nucifora F.C. Jr., Li S.-H., Danoff S., Ullrich A., Ross C.A. (1995). Molecular cloning of a cDNA for the human inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1, and the identification of a third alternatively spliced variant. Brain Res. Mol. Brain Res. 32: 291—296. PMID 7500840 DOI:10.1016/0169-328X(95)00089-B
  • Yan J., Khanna K.K., Lavin M.F. (1996). Induction of inositol 1,4,5 trisphosphate receptor genes by ionizing radiation. Int. J. Radiat. Biol. 69: 539—546. PMID 8648241 DOI:10.1080/095530096145544
  • Ando H., Mizutani A., Mikoshiba K. (2009). An IRBIT homologue lacks binding activity to inositol 1,4,5-trisphosphate receptor due to the unique N-terminal appendage. J. Neurochem. 109: 539—550. PMID 19220705 DOI:10.1111/j.1471-4159.2009.05979.x
  • Schulman J.J., Wright F.A., Kaufmann T., Wojcikiewicz R.J. (2013). The Bcl-2 protein family member Bok binds to the coupling domain of inositol 1,4,5-trisphosphate receptors and protects them from proteolytic cleavage. J. Biol. Chem. 288: 25340—25349. PMID 23884412 DOI:10.1074/jbc.M113.496570

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з ITPR1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6180 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
  6. UniProt, Q14643 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 3
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
 
Ліганд-залежні
Потенціалкеровані
  • L-тип/Cavα
  • N-тип/Cavα2.2
  • P-тип/Cavα
  • Q-тип/Cavα2.1
  • R-тип/Cavα2.3
  • T-тип/Cavα
 
постійно відчинені
Протончутливі
  • Кислота
Потенціалкеровані
 
K+: Калієві канали
Кальцій-активовані
Вхідного випрямлення
Двопородоменні
Потенціалкеровані
 
Різні
Cl: Хлорні канали
H+: Протонні канали
M+: CNG-канали
M+: TRP-канали
H2O (+ розчини): Порини
Цитоплазма: Щілинні контакти
 
За механізмом залежності
Ion channel class