KCNT1

Ідентифікатори

Символи

KCNT1, EIEE14, ENFL5, KCa4.1, SLACK, bA100C15.2, Slo2.2, potassium sodium-activated channel subfamily T member 1, DEE14

Зовнішні ІД

OMIM: 608167 MGI: 1924627 HomoloGene: 11055 GeneCards: KCNT1

Пов'язані генетичні захворювання

autosomal dominant nocturnal frontal lobe epilepsy 5, Epilepsy in children, epileptic encephalopathy, early infantile, 14^[1]

Реагує на сполуку

Локсапін, Ніклозамід, tetraethylammonium^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• voltage-gated potassium channel activity • potassium channel activity • calcium-activated potassium channel activity • intracellular sodium activated potassium channel activity • outward rectifier potassium channel activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • voltage-gated potassium channel complex • клітинна мембрана • мембрана
Біологічний процес	• potassium ion transport • ion transport • potassium ion transmembrane transport • regulation of membrane potential
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


57582


227632

Ensembl


ENSG00000107147


ENSMUSG00000058740

UniProt


Q5JUK3


Q6ZPR4

RefSeq (мРНК)


NM_001272003 NM_020822


NM_001145403 NM_175462 NM_001302351

RefSeq (білок)


NP_001258932 NP_065873


NP_001138875 NP_001289280 NP_780671

Локус (UCSC)

Хр. 9: 135.7 – 135.8 Mb

Хр. 2: 25.75 – 25.81 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

KCNT1 (англ. Potassium sodium-activated channel subfamily T member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 230 амінокислот, а молекулярна маса — 138 343^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MARAKLPRSP	SEGKAGPGGA	PAGAAAPEEP	HGLSPLLPAR	GGGSVGSDVG
QRLPVEDFSL	DSSLSQVQVE	FYVNENTFKE	RLKLFFIKNQ	RSSLRIRLFN
FSLKLLTCLL	YIVRVLLDDP	ALGIGCWGCP	KQNYSFNDSS	SEINWAPILW
VERKMTLWAI	QVIVAIISFL	ETMLLIYLSY	KGNIWEQIFR	VSFVLEMINT
LPFIITIFWP	PLRNLFIPVF	LNCWLAKHAL	ENMINDFHRA	ILRTQSAMFN
QVLILFCTLL	CLVFTGTCGI	QHLERAGENL	SLLTSFYFCI	VTFSTVGYGD
VTPKIWPSQL	LVVIMICVAL	VVLPLQFEEL	VYLWMERQKS	GGNYSRHRAQ
TEKHVVLCVS	SLKIDLLMDF	LNEFYAHPRL	QDYYVVILCP	TEMDVQVRRV
LQIPLWSQRV	IYLQGSALKD	QDLMRAKMDN	GEACFILSSR	NEVDRTAADH
QTILRAWAVK	DFAPNCPLYV	QILKPENKFH	VKFADHVVCE	EECKYAMLAL
NCICPATSTL	ITLLVHTSRG	QEGQESPEQW	QRMYGRCSGN	EVYHIRMGDS
KFFREYEGKS	FTYAAFHAHK	KYGVCLIGLK	REDNKSILLN	PGPRHILAAS
DTCFYINITK	EENSAFIFKQ	EEKRKKRAFS	GQGLHEGPAR	LPVHSIIASM
GTVAMDLQGT	EHRPTQSGGG	GGGSKLALPT	ENGSGSRRPS	IAPVLELADS
SALLPCDLLS	DQSEDEVTPS	DDEGLSVVEY	VKGYPPNSPY	IGSSPTLCHL
LPVKAPFCCL	RLDKGCKHNS	YEDAKAYGFK	NKLIIVSAET	AGNGLYNFIV
PLRAYYRSRK	ELNPIVLLLD	NKPDHHFLEA	ICCFPMVYYM	EGSVDNLDSL
LQCGIIYADN	LVVVDKESTM	SAEEDYMADA	KTIVNVQTMF	RLFPSLSITT
ELTHPSNMRF	MQFRAKDSYS	LALSKLEKRE	RENGSNLAFM	FRLPFAAGRV
FSISMLDTLL	YQSFVKDYMI	TITRLLLGLD	TTPGSGYLCA	MKITEGDLWI
RTYGRLFQKL	CSSSAEIPIG	IYRTESHVFS	TSESQISVNV	EDCEDTREVK
GPWGSRAGTG	GSSQGRHTGG	GDPAEHPLLR	RKSLQWARRL	SRKAPKQAGR
AAAAEWISQQ	RLSLYRRSER	QELSELVKNR	MKHLGLPTTG	YEDVANLTAS
DVMNRVNLGY	LQDEMNDHQN	TLSYVLINPP	PDTRLEPSDI	VYLIRSDPLA
HVASSSQSRK	SSCSHKLSSC	NPETRDETQL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, калію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з KCNT1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Potassium sodium-activated channel subfamily T member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18865 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q5JUK3 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 9

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані