TRPM4 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRPM4, PFHB1B, TRPM4B, LTrpC4, htransient receptor potential cation channel subfamily M member 4, EKVP6 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606936 MGI: 1915917 HomoloGene: 23033 GeneCards: TRPM4 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
progressive familial heart block type IB, progressive familial heart block[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
Аденозинтрифосфат, spermine, Аденозин, Аденозинмонофосфат, Аденозиндифосфат, AMP-PNP, клотримазол[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • calcium channel activity • calmodulin binding • ion channel activity • ATP binding • sodium channel activity • calcium activated cation channel activity • calcium ion binding • зв'язування з іоном металу |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • клітинна мембрана • нуклеоплазма • ендоплазматичний ретикулум • гіалоплазма • neuronal cell body • sodium channel complex • spanning component of plasma membrane • spanning component of membrane |
---|
Біологічний процес | • адаптивна імунна відповідь • вазоконстрикція • процес імунної системи • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • regulation of membrane potential • cation transport • ion transport • protein sumoylation • dendritic cell chemotaxis • regulation of T cell cytokine production • cardiac conduction • positive regulation of cell population proliferation • calcium ion transport • negative regulation of bone mineralization • positive regulation of atrial cardiac muscle cell action potential • positive regulation of heart rate • трансмембранний транспорт • positive regulation of adipose tissue development • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration • calcium ion transmembrane transport • positive regulation of fat cell differentiation • positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus • negative regulation of osteoblast differentiation • positive regulation of vasoconstriction • positive regulation of regulation of vascular associated smooth muscle cell membrane depolarization • ion transmembrane transport • calcium-mediated signaling • membrane depolarization during AV node cell action potential • membrane depolarization during Purkinje myocyte cell action potential • membrane depolarization during bundle of His cell action potential • regulation of heart rate by cardiac conduction • sodium ion import across plasma membrane • regulation of ventricular cardiac muscle cell action potential • protein homotetramerization • cellular response to ATP • inorganic cation transmembrane transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/6b/PBB_GE_TRPM4_219360_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_TRPM4_219360_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001195227 NM_017636 NM_001321281 NM_001321282 NM_001321283
| NM_001321285 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001182156 NP_001308210 NP_001308211 NP_001308212 NP_001308214
| NP_060106 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 49.16 – 49.21 Mb | Хр. 7: 44.95 – 44.98 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRPM4 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily M member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 214 амінокислот, а молекулярна маса — 134 301[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MVVPEKEQSW | | IPKIFKKKTC | | TTFIVDSTDP | | GGTLCQCGRP | | RTAHPAVAME |
DAFGAAVVTV | | WDSDAHTTEK | | PTDAYGELDF | | TGAGRKHSNF | | LRLSDRTDPA |
AVYSLVTRTW | | GFRAPNLVVS | | VLGGSGGPVL | | QTWLQDLLRR | | GLVRAAQSTG |
AWIVTGGLHT | | GIGRHVGVAV | | RDHQMASTGG | | TKVVAMGVAP | | WGVVRNRDTL |
INPKGSFPAR | | YRWRGDPEDG | | VQFPLDYNYS | | AFFLVDDGTH | | GCLGGENRFR |
LRLESYISQQ | | KTGVGGTGID | | IPVLLLLIDG | | DEKMLTRIEN | | ATQAQLPCLL |
VAGSGGAADC | | LAETLEDTLA | | PGSGGARQGE | | ARDRIRRFFP | | KGDLEVLQAQ |
VERIMTRKEL | | LTVYSSEDGS | | EEFETIVLKA | | LVKACGSSEA | | SAYLDELRLA |
VAWNRVDIAQ | | SELFRGDIQW | | RSFHLEASLM | | DALLNDRPEF | | VRLLISHGLS |
LGHFLTPMRL | | AQLYSAAPSN | | SLIRNLLDQA | | SHSAGTKAPA | | LKGGAAELRP |
PDVGHVLRML | | LGKMCAPRYP | | SGGAWDPHPG | | QGFGESMYLL | | SDKATSPLSL |
DAGLGQAPWS | | DLLLWALLLN | | RAQMAMYFWE | | MGSNAVSSAL | | GACLLLRVMA |
RLEPDAEEAA | | RRKDLAFKFE | | GMGVDLFGEC | | YRSSEVRAAR | | LLLRRCPLWG |
DATCLQLAMQ | | ADARAFFAQD | | GVQSLLTQKW | | WGDMASTTPI | | WALVLAFFCP |
PLIYTRLITF | | RKSEEEPTRE | | ELEFDMDSVI | | NGEGPVGTAD | | PAEKTPLGVP |
RQSGRPGCCG | | GRCGGRRCLR | | RWFHFWGAPV | | TIFMGNVVSY | | LLFLLLFSRV |
LLVDFQPAPP | | GSLELLLYFW | | AFTLLCEELR | | QGLSGGGGSL | | ASGGPGPGHA |
SLSQRLRLYL | | ADSWNQCDLV | | ALTCFLLGVG | | CRLTPGLYHL | | GRTVLCIDFM |
VFTVRLLHIF | | TVNKQLGPKI | | VIVSKMMKDV | | FFFLFFLGVW | | LVAYGVATEG |
LLRPRDSDFP | | SILRRVFYRP | | YLQIFGQIPQ | | EDMDVALMEH | | SNCSSEPGFW |
AHPPGAQAGT | | CVSQYANWLV | | VLLLVIFLLV | | ANILLVNLLI | | AMFSYTFGKV |
QGNSDLYWKA | | QRYRLIREFH | | SRPALAPPFI | | VISHLRLLLR | | QLCRRPRSPQ |
PSSPALEHFR | | VYLSKEAERK | | LLTWESVHKE | | NFLLARARDK | | RESDSERLKR |
TSQKVDLALK | | QLGHIREYEQ | | RLKVLEREVQ | | QCSRVLGWVA | | EALSRSALLP |
PGGPPPPDLP | | GSKD |
Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як адаптивний імунітет, імунітет, транспорт іонів, транспорт. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, молекулою кальмодуліну, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті Гольджі.
Це іонний канал, селективний до моновалентних катіонів - натрію та калію. Активується іонами кальцію з цитоалазматичного боку[7].
Література
- Xu X.-Z.S., Moebius F., Gill D.L., Montell C. (2001). Regulation of melastatin, a TRP-related protein, through interaction with a cytoplasmic isoform. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 10692—10697. PMID 11535825 DOI:10.1073/pnas.191360198
- Hofmann T., Chubanov V., Gudermann T., Montell C. (2003). TRPM5 is a voltage-modulated and Ca(2+)-activated monovalent selective cation channel. Curr. Biol. 13: 1153—1158. PMID 12842017 DOI:10.1016/S0960-9822(03)00431-7
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Earley S., Waldron B.J., Brayden J.E. (2004). Critical role for transient receptor potential channel TRPM4 in myogenic constriction of cerebral arteries. Circ. Res. 95: 922—929. PMID 15472118 DOI:10.1161/01.RES.0000147311.54833.03
- Nilius B., Prenen J., Janssens A., Voets T., Droogmans G. (2004). Decavanadate modulates gating of TRPM4 cation channels. J. Physiol. (Lond.). 560: 753—765. PMID 15331675 DOI:10.1113/jphysiol.2004.070839
- Nilius B., Prenen J., Voets T., Droogmans G. (2004). Intracellular nucleotides and polyamines inhibit the Ca2+-activated cation channel TRPM4b. Pflugers Arch. 448: 70—75. PMID 14758478 DOI:10.1007/s00424-003-1221-x
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TRPM4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily M member 4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17993 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 22 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q8TD43 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
- ↑ J. Duan et al., Structure of full-length human TRPM4. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 115, 2377–2382 (2018)(англ.)
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
| |
---|
| Ліганд-залежні | |
---|
| Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
| | |
---|
| постійно відчинені | |
---|
| Протончутливі | |
---|
| Потенціалкеровані | |
---|
|
| | K+: Калієві канали |
---|
| Кальцій-активовані | |
---|
| Вхідного випрямлення | |
---|
| Двопородоменні | |
---|
| Потенціалкеровані | |
---|
|
| | | | |
|