TRPM4

TRPM4
Ідентифікатори
Символи TRPM4, PFHB1B, TRPM4B, LTrpC4, htransient receptor potential cation channel subfamily M member 4, EKVP6
Зовнішні ІД OMIM: 606936 MGI: 1915917 HomoloGene: 23033 GeneCards: TRPM4
Пов'язані генетичні захворювання
progressive familial heart block type IB, progressive familial heart block[1]
Реагує на сполуку
Аденозинтрифосфат, spermine, Аденозин, Аденозинмонофосфат, Аденозиндифосфат, AMP-PNP, клотримазол[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

nucleotide binding
calcium channel activity
calmodulin binding
ion channel activity
ATP binding
sodium channel activity
calcium activated cation channel activity
calcium ion binding
зв'язування з іоном металу

Клітинна компонента

integral component of membrane
комплекс Ґольджі
мембрана
клітинна мембрана
нуклеоплазма
ендоплазматичний ретикулум
гіалоплазма
neuronal cell body
sodium channel complex
spanning component of plasma membrane
spanning component of membrane

Біологічний процес

адаптивна імунна відповідь
вазоконстрикція
процес імунної системи
positive regulation of canonical Wnt signaling pathway
regulation of membrane potential
cation transport
ion transport
protein sumoylation
dendritic cell chemotaxis
regulation of T cell cytokine production
cardiac conduction
positive regulation of cell population proliferation
calcium ion transport
negative regulation of bone mineralization
positive regulation of atrial cardiac muscle cell action potential
positive regulation of heart rate
трансмембранний транспорт
positive regulation of adipose tissue development
positive regulation of cytosolic calcium ion concentration
calcium ion transmembrane transport
positive regulation of fat cell differentiation
positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus
negative regulation of osteoblast differentiation
positive regulation of vasoconstriction
positive regulation of regulation of vascular associated smooth muscle cell membrane depolarization
ion transmembrane transport
calcium-mediated signaling
membrane depolarization during AV node cell action potential
membrane depolarization during Purkinje myocyte cell action potential
membrane depolarization during bundle of His cell action potential
regulation of heart rate by cardiac conduction
sodium ion import across plasma membrane
regulation of ventricular cardiac muscle cell action potential
protein homotetramerization
cellular response to ATP
inorganic cation transmembrane transport

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
54795
68667
Ensembl
ENSG00000130529
ENSMUSG00000038260
UniProt
Q8TD43
Q7TN37
RefSeq (мРНК)
NM_001195227
NM_017636
NM_001321281
NM_001321282
NM_001321283
NM_001321285
NM_175130
RefSeq (білок)
NP_001182156
NP_001308210
NP_001308211
NP_001308212
NP_001308214
NP_060106
NP_780339
Локус (UCSC) Хр. 19: 49.16 – 49.21 Mb Хр. 7: 44.95 – 44.98 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TRPM4 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily M member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 214 амінокислот, а молекулярна маса — 134 301[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MVVPEKEQSWIPKIFKKKTCTTFIVDSTDPGGTLCQCGRPRTAHPAVAME
DAFGAAVVTVWDSDAHTTEKPTDAYGELDFTGAGRKHSNFLRLSDRTDPA
AVYSLVTRTWGFRAPNLVVSVLGGSGGPVLQTWLQDLLRRGLVRAAQSTG
AWIVTGGLHTGIGRHVGVAVRDHQMASTGGTKVVAMGVAPWGVVRNRDTL
INPKGSFPARYRWRGDPEDGVQFPLDYNYSAFFLVDDGTHGCLGGENRFR
LRLESYISQQKTGVGGTGIDIPVLLLLIDGDEKMLTRIENATQAQLPCLL
VAGSGGAADCLAETLEDTLAPGSGGARQGEARDRIRRFFPKGDLEVLQAQ
VERIMTRKELLTVYSSEDGSEEFETIVLKALVKACGSSEASAYLDELRLA
VAWNRVDIAQSELFRGDIQWRSFHLEASLMDALLNDRPEFVRLLISHGLS
LGHFLTPMRLAQLYSAAPSNSLIRNLLDQASHSAGTKAPALKGGAAELRP
PDVGHVLRMLLGKMCAPRYPSGGAWDPHPGQGFGESMYLLSDKATSPLSL
DAGLGQAPWSDLLLWALLLNRAQMAMYFWEMGSNAVSSALGACLLLRVMA
RLEPDAEEAARRKDLAFKFEGMGVDLFGECYRSSEVRAARLLLRRCPLWG
DATCLQLAMQADARAFFAQDGVQSLLTQKWWGDMASTTPIWALVLAFFCP
PLIYTRLITFRKSEEEPTREELEFDMDSVINGEGPVGTADPAEKTPLGVP
RQSGRPGCCGGRCGGRRCLRRWFHFWGAPVTIFMGNVVSYLLFLLLFSRV
LLVDFQPAPPGSLELLLYFWAFTLLCEELRQGLSGGGGSLASGGPGPGHA
SLSQRLRLYLADSWNQCDLVALTCFLLGVGCRLTPGLYHLGRTVLCIDFM
VFTVRLLHIFTVNKQLGPKIVIVSKMMKDVFFFLFFLGVWLVAYGVATEG
LLRPRDSDFPSILRRVFYRPYLQIFGQIPQEDMDVALMEHSNCSSEPGFW
AHPPGAQAGTCVSQYANWLVVLLLVIFLLVANILLVNLLIAMFSYTFGKV
QGNSDLYWKAQRYRLIREFHSRPALAPPFIVISHLRLLLRQLCRRPRSPQ
PSSPALEHFRVYLSKEAERKLLTWESVHKENFLLARARDKRESDSERLKR
TSQKVDLALKQLGHIREYEQRLKVLEREVQQCSRVLGWVAEALSRSALLP
PGGPPPPDLPGSKD

Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як адаптивний імунітет, імунітет, транспорт іонів, транспорт. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, молекулою кальмодуліну, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті Гольджі.

Це іонний канал, селективний до моновалентних катіонів - натрію та калію. Активується іонами кальцію з цитоалазматичного боку[7].

Література

  • Xu X.-Z.S., Moebius F., Gill D.L., Montell C. (2001). Regulation of melastatin, a TRP-related protein, through interaction with a cytoplasmic isoform. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 10692—10697. PMID 11535825 DOI:10.1073/pnas.191360198
  • Hofmann T., Chubanov V., Gudermann T., Montell C. (2003). TRPM5 is a voltage-modulated and Ca(2+)-activated monovalent selective cation channel. Curr. Biol. 13: 1153—1158. PMID 12842017 DOI:10.1016/S0960-9822(03)00431-7
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Earley S., Waldron B.J., Brayden J.E. (2004). Critical role for transient receptor potential channel TRPM4 in myogenic constriction of cerebral arteries. Circ. Res. 95: 922—929. PMID 15472118 DOI:10.1161/01.RES.0000147311.54833.03
  • Nilius B., Prenen J., Janssens A., Voets T., Droogmans G. (2004). Decavanadate modulates gating of TRPM4 cation channels. J. Physiol. (Lond.). 560: 753—765. PMID 15331675 DOI:10.1113/jphysiol.2004.070839
  • Nilius B., Prenen J., Voets T., Droogmans G. (2004). Intracellular nucleotides and polyamines inhibit the Ca2+-activated cation channel TRPM4b. Pflugers Arch. 448: 70—75. PMID 14758478 DOI:10.1007/s00424-003-1221-x

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з TRPM4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily M member 4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17993 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 22 серпня 2017.
  6. UniProt, Q8TD43 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
  7. J. Duan et al., Structure of full-length human TRPM4. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 115, 2377–2382 (2018)(англ.)

Див. також

  • Хромосома 19
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
 
Ліганд-залежні
Потенціалкеровані
  • L-тип/Cavα
  • N-тип/Cavα2.2
  • P-тип/Cavα
  • Q-тип/Cavα2.1
  • R-тип/Cavα2.3
  • T-тип/Cavα
 
постійно відчинені
Протончутливі
  • Кислота
Потенціалкеровані
 
K+: Калієві канали
Кальцій-активовані
Вхідного випрямлення
Двопородоменні
Потенціалкеровані
 
Різні
Cl: Хлорні канали
H+: Протонні канали
M+: CNG-канали
M+: TRP-канали
H2O (+ розчини): Порини
Цитоплазма: Щілинні контакти
 
За механізмом залежності
Ion channel class