TRPV2 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/2b/Protein_TRPV2_PDB_2f37.png/250px-Protein_TRPV2_PDB_2f37.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRPV2, VRL, VRL-1, VRL1, transient receptor potential cation channel subfamily V member 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606676 MGI: 1341836 HomoloGene: 7993 GeneCards: TRPV2 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
Канабідіол, амілорид[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • ion transmembrane transporter activity • ion channel activity • cation channel activity • calcium channel activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • integral component of membrane • cell body • мембрана • Меланосома • клітинна мембрана • growth cone membrane • axonal growth cone • integral component of plasma membrane • внутрішньоклітинний • cell surface • аксон |
---|
Біологічний процес | • sensory perception • response to heat • ion transport • positive regulation of calcium ion import • calcium ion transmembrane transport • positive regulation of axon extension • response to temperature stimulus • calcium ion transport • трансмембранний транспорт • positive regulation of cold-induced thermogenesis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/78/PBB_GE_TRPV2_219282_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_TRPV2_219282_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_011706 NM_001382489 NM_001382490 NM_001382491 NM_001382492 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_035836 NP_001369418 NP_001369419 NP_001369420 NP_001369421 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 16.42 – 16.44 Mb | Хр. 11: 62.47 – 62.49 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRPV2 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 764 амінокислот, а молекулярна маса — 85 981[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTSPSSSPVF | | RLETLDGGQE | | DGSEADRGKL | | DFGSGLPPME | | SQFQGEDRKF |
APQIRVNLNY | | RKGTGASQPD | | PNRFDRDRLF | | NAVSRGVPED | | LAGLPEYLSK |
TSKYLTDSEY | | TEGSTGKTCL | | MKAVLNLKDG | | VNACILPLLQ | | IDRDSGNPQP |
LVNAQCTDDY | | YRGHSALHIA | | IEKRSLQCVK | | LLVENGANVH | | ARACGRFFQK |
GQGTCFYFGE | | LPLSLAACTK | | QWDVVSYLLE | | NPHQPASLQA | | TDSQGNTVLH |
ALVMISDNSA | | ENIALVTSMY | | DGLLQAGARL | | CPTVQLEDIR | | NLQDLTPLKL |
AAKEGKIEIF | | RHILQREFSG | | LSHLSRKFTE | | WCYGPVRVSL | | YDLASVDSCE |
ENSVLEIIAF | | HCKSPHRHRM | | VVLEPLNKLL | | QAKWDLLIPK | | FFLNFLCNLI |
YMFIFTAVAY | | HQPTLKKQAA | | PHLKAEVGNS | | MLLTGHILIL | | LGGIYLLVGQ |
LWYFWRRHVF | | IWISFIDSYF | | EILFLFQALL | | TVVSQVLCFL | | AIEWYLPLLV |
SALVLGWLNL | | LYYTRGFQHT | | GIYSVMIQKV | | ILRDLLRFLL | | IYLVFLFGFA |
VALVSLSQEA | | WRPEAPTGPN | | ATESVQPMEG | | QEDEGNGAQY | | RGILEASLEL |
FKFTIGMGEL | | AFQEQLHFRG | | MVLLLLLAYV | | LLTYILLLNM | | LIALMSETVN |
SVATDSWSIW | | KLQKAISVLE | | MENGYWWCRK | | KQRAGVMLTV | | GTKPDGSPDE |
RWCFRVEEVN | | WASWEQTLPT | | LCEDPSGAGV | | PRTLENPVLA | | SPPKEDEDGA |
SEENYVPVQL | | LQSN |
Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.
Література
- Caterina M.J., Rosen T.A., Tominaga M., Brake A.J., Julius D. (1999). A capsaicin-receptor homologue with a high threshold for noxious heat. Nature. 398: 436—441. PMID 10201375 DOI:10.1038/18906
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- McCleverty C.J., Koesema E., Patapoutian A., Lesley S.A., Kreusch A. (2006). Crystal structure of the human TRPV2 channel ankyrin repeat domain. Protein Sci. 15: 2201—2206. PMID 16882997 DOI:10.1110/ps.062357206
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18082 (англ.) . Архів оригіналу за 15 травня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y5S1 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
| |
---|
| Ліганд-залежні | |
---|
| Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
| | |
---|
| постійно відчинені | |
---|
| Протончутливі | |
---|
| Потенціалкеровані | |
---|
|
| | K+: Калієві канали |
---|
| Кальцій-активовані | |
---|
| Вхідного випрямлення | |
---|
| Двопородоменні | |
---|
| Потенціалкеровані | |
---|
|
| | | | |
|