TRPV2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2F37

Ідентифікатори

Символи

TRPV2, VRL, VRL-1, VRL1, transient receptor potential cation channel subfamily V member 2

Зовнішні ІД

OMIM: 606676 MGI: 1341836 HomoloGene: 7993 GeneCards: TRPV2

Реагує на сполуку

Канабідіол, амілорид^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• ion transmembrane transporter activity • ion channel activity • cation channel activity • calcium channel activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • cell body • мембрана • Меланосома • клітинна мембрана • growth cone membrane • axonal growth cone • integral component of plasma membrane • внутрішньоклітинний • cell surface • аксон
Біологічний процес	• sensory perception • response to heat • ion transport • positive regulation of calcium ion import • calcium ion transmembrane transport • positive regulation of axon extension • response to temperature stimulus • calcium ion transport • трансмембранний транспорт • positive regulation of cold-induced thermogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


51393


22368

Ensembl


ENSG00000187688


ENSMUSG00000018507

UniProt


Q9Y5S1


Q9WTR1

RefSeq (мРНК)


NM_016113


NM_011706 NM_001382489 NM_001382490 NM_001382491 NM_001382492

RefSeq (білок)


NP_057197


NP_035836 NP_001369418 NP_001369419 NP_001369420 NP_001369421

Локус (UCSC)

Хр. 17: 16.42 – 16.44 Mb

Хр. 11: 62.47 – 62.49 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRPV2 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 764 амінокислот, а молекулярна маса — 85 981^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTSPSSSPVF	RLETLDGGQE	DGSEADRGKL	DFGSGLPPME	SQFQGEDRKF
APQIRVNLNY	RKGTGASQPD	PNRFDRDRLF	NAVSRGVPED	LAGLPEYLSK
TSKYLTDSEY	TEGSTGKTCL	MKAVLNLKDG	VNACILPLLQ	IDRDSGNPQP
LVNAQCTDDY	YRGHSALHIA	IEKRSLQCVK	LLVENGANVH	ARACGRFFQK
GQGTCFYFGE	LPLSLAACTK	QWDVVSYLLE	NPHQPASLQA	TDSQGNTVLH
ALVMISDNSA	ENIALVTSMY	DGLLQAGARL	CPTVQLEDIR	NLQDLTPLKL
AAKEGKIEIF	RHILQREFSG	LSHLSRKFTE	WCYGPVRVSL	YDLASVDSCE
ENSVLEIIAF	HCKSPHRHRM	VVLEPLNKLL	QAKWDLLIPK	FFLNFLCNLI
YMFIFTAVAY	HQPTLKKQAA	PHLKAEVGNS	MLLTGHILIL	LGGIYLLVGQ
LWYFWRRHVF	IWISFIDSYF	EILFLFQALL	TVVSQVLCFL	AIEWYLPLLV
SALVLGWLNL	LYYTRGFQHT	GIYSVMIQKV	ILRDLLRFLL	IYLVFLFGFA
VALVSLSQEA	WRPEAPTGPN	ATESVQPMEG	QEDEGNGAQY	RGILEASLEL
FKFTIGMGEL	AFQEQLHFRG	MVLLLLLAYV	LLTYILLLNM	LIALMSETVN
SVATDSWSIW	KLQKAISVLE	MENGYWWCRK	KQRAGVMLTV	GTKPDGSPDE
RWCFRVEEVN	WASWEQTLPT	LCEDPSGAGV	PRTLENPVLA	SPPKEDEDGA
SEENYVPVQL	LQSN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

Caterina M.J., Rosen T.A., Tominaga M., Brake A.J., Julius D. (1999). A capsaicin-receptor homologue with a high threshold for noxious heat. Nature. 398: 436—441. PMID 10201375 DOI:10.1038/18906
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
McCleverty C.J., Koesema E., Patapoutian A., Lesley S.A., Kreusch A. (2006). Crystal structure of the human TRPV2 channel ankyrin repeat domain. Protein Sci. 15: 2201—2206. PMID 16882997 DOI:10.1110/ps.062357206

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18082 (англ.) . Архів оригіналу за 15 травня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9Y5S1 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 17

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані