CLCA2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CLCA2, CACC, CACC3, CLCRG2, CaCC-3, chloride channel accessory 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604003 MGI: 2139758 HomoloGene: 4765 GeneCards: CLCA2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • ligand-gated ion channel activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • chloride channel activity • metalloendopeptidase activity • intracellular calcium activated chloride channel activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • integral component of plasma membrane • extracellular region • міжклітинні контакти • basal plasma membrane • клітинне ядро • гіалоплазма • клітинна мембрана • ядерна мембрана |
---|
Біологічний процес | • chloride transmembrane transport • ion transport • протеоліз • адгезія клітин • chloride transport • ion transmembrane transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/8e/PBB_GE_CLCA2_206165_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_CLCA2_206165_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d0/PBB_GE_CLCA2_206164_at_fs.png/250px-PBB_GE_CLCA2_206164_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/db/PBB_GE_CLCA2_206166_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_CLCA2_206166_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 86.42 – 86.46 Mb | Хр. 3: 144.78 – 144.81 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CLCA2 (англ. Chloride channel accessory 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 943 амінокислот, а молекулярна маса — 103 941[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTQRSIAGPI | | CNLKFVTLLV | | ALSSELPFLG | | AGVQLQDNGY | | NGLLIAINPQ |
VPENQNLISN | | IKEMITEASF | | YLFNATKRRV | | FFRNIKILIP | | ATWKANNNSK |
IKQESYEKAN | | VIVTDWYGAH | | GDDPYTLQYR | | GCGKEGKYIH | | FTPNFLLNDN |
LTAGYGSRGR | | VFVHEWAHLR | | WGVFDEYNND | | KPFYINGQNQ | | IKVTRCSSDI |
TGIFVCEKGP | | CPQENCIISK | | LFKEGCTFIY | | NSTQNATASI | | MFMQSLSSVV |
EFCNASTHNQ | | EAPNLQNQMC | | SLRSAWDVIT | | DSADFHHSFP | | MNGTELPPPP |
TFSLVQAGDK | | VVCLVLDVSS | | KMAEADRLLQ | | LQQAAEFYLM | | QIVEIHTFVG |
IASFDSKGEI | | RAQLHQINSN | | DDRKLLVSYL | | PTTVSAKTDI | | SICSGLKKGF |
EVVEKLNGKA | | YGSVMILVTS | | GDDKLLGNCL | | PTVLSSGSTI | | HSIALGSSAA |
PNLEELSRLT | | GGLKFFVPDI | | SNSNSMIDAF | | SRISSGTGDI | | FQQHIQLEST |
GENVKPHHQL | | KNTVTVDNTV | | GNDTMFLVTW | | QASGPPEIIL | | FDPDGRKYYT |
NNFITNLTFR | | TASLWIPGTA | | KPGHWTYTLN | | NTHHSLQALK | | VTVTSRASNS |
AVPPATVEAF | | VERDSLHFPH | | PVMIYANVKQ | | GFYPILNATV | | TATVEPETGD |
PVTLRLLDDG | | AGADVIKNDG | | IYSRYFFSFA | | ANGRYSLKVH | | VNHSPSISTP |
AHSIPGSHAM | | YVPGYTANGN | | IQMNAPRKSV | | GRNEEERKWG | | FSRVSSGGSF |
SVLGVPAGPH | | PDVFPPCKII | | DLEAVKVEEE | | LTLSWTAPGE | | DFDQGQATSY |
EIRMSKSLQN | | IQDDFNNAIL | | VNTSKRNPQQ | | AGIREIFTFS | | PQISTNGPEH |
QPNGETHESH | | RIYVAIRAMD | | RNSLQSAVSN | | IAQAPLFIPP | | NSDPVPARDY |
LILKGVLTAM | | GLIGIICLII | | VVTHHTLSRK | | KRADKKENGT | | KLL |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, транспорт іонів, транспорт, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію, хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах. Також секретований назовні.
Література
- Agnel M., Vermat T., Culouscou J.-M. (1999). Identification of three novel members of the calcium-dependent chloride channel (CaCC) family predominantly expressed in the digestive tract and trachea. FEBS Lett. 455: 295—301. PMID 10437792 DOI:10.1016/S0014-5793(99)00891-1
- Itoh R., Kawamoto S., Miyamoto Y., Kinoshita S., Okubo K. (2000). Isolation and characterization of a Ca(2+)-activated chloride channel from human corneal epithelium. Curr. Eye Res. 21: 918—925. PMID 11262615 DOI:10.1076/ceyr.21.6.918.6983
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Bustin S.A., Li S.-R., Dorudi S. (2001). Expression of the Ca2+-activated chloride channel genes CLCA1 and CLCA2 is downregulated in human colorectal cancer. DNA Cell Biol. 20: 331—338. PMID 11445004 DOI:10.1089/10445490152122442
- Abdel-Ghany M., Cheng H.-C., Elble R.C., Pauli B.U. (2001). The breast cancer beta 4 integrin and endothelial human CLCA2 mediate lung metastasis. J. Biol. Chem. 276: 25438—25446. PMID 11320086 DOI:10.1074/jbc.M100478200
- Connon C.J., Kawasaki S., Yamasaki K., Quantock A.J., Kinoshita S. (2005). The quantification of hCLCA2 and colocalisation with integrin beta4 in stratified human epithelia. Acta Histochem. 106: 421—425. PMID 15707651 DOI:10.1016/j.acthis.2004.08.003
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2016 (англ.) . Архів оригіналу за 11 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UQC9 (англ.) . Архів оригіналу за 20 жовтня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
| |
---|
| Ліганд-залежні | |
---|
| Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
| | |
---|
| постійно відчинені | |
---|
| Протончутливі | |
---|
| Потенціалкеровані | |
---|
|
| | K+: Калієві канали |
---|
| Кальцій-активовані | |
---|
| Вхідного випрямлення | |
---|
| Двопородоменні | |
---|
| Потенціалкеровані | |
---|
|
| | | | |
|