TRPC3

TRPC3
Ідентифікатори
Символи TRPC3, SCA41, TRP3, transient receptor potential cation channel subfamily C member 3
Зовнішні ІД OMIM: 602345 MGI: 109526 HomoloGene: 20708 GeneCards: TRPC3
Пов'язані генетичні захворювання
spinocerebellar ataxia type 41[1]
Реагує на сполуку
2-aminoethoxydiphenylborate[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

store-operated calcium channel activity
calcium channel activity
inositol 1,4,5 trisphosphate binding
ion channel activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding

Клітинна компонента

integral component of membrane
мембрана
клітинна мембрана
integral component of plasma membrane
cation channel complex

Біологічний процес

response to ATP
positive regulation of calcium ion transport into cytosol
ion transport
single fertilization
platelet activation
response to calcium ion
calcium ion transmembrane transport
positive regulation of cardiac muscle hypertrophy in response to stress
manganese ion transport
calcium ion transport
phototransduction
трансмембранний транспорт
regulation of cytosolic calcium ion concentration

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7222
22065
Ensembl
ENSG00000138741
ENSMUSG00000027716
UniProt
Q13507
Q9QZC1
RefSeq (мРНК)
NM_001130698
NM_003305
NM_001366479
NM_019510
RefSeq (білок)
NP_001124170
NP_003296
NP_001353408
н/д
Локус (UCSC) Хр. 4: 121.87 – 121.95 Mb Хр. 3: 36.67 – 36.74 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TRPC3 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily C member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 836 амінокислот, а молекулярна маса — 96 009[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MREKGRRQAVRGPAFMFNDRGTSLTAEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEES
KTLNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKENLARIGDALLLAISK
GYVRIVEAILNHPGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAYDEDGTRFSPDIT
PIILAAHCQKYEVVHMLLMKGARIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSHSR
SRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVLTALELSNELAKLANIEKEFKNDYRKL
SMQCKDFVVGVLDLCRDSEEVEAILNGDLESAEPLEVHRHKASLSRVKLA
IKYEVKKFVAHPNCQQQLLTIWYENLSGLREQTIAIKCLVVLVVALGLPF
LAIGYWIAPCSRLGKILRSPFMKFVAHAASFIIFLGLLVFNASDRFEGIT
TLPNITVTDYPKQIFRVKTTQFTWTEMLIMVWVLGMMWSECKELWLEGPR
EYILQLWNVLDFGMLSIFIAAFTARFLAFLQATKAQQYVDSYVQESDLSE
VTLPPEIQYFTYARDKWLPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANES
FGPLQISLGRTVKDIFKFMVLFIMVFFAFMIGMFILYSYYLGAKVNAAFT
TVEESFKTLFWSIFGLSEVTSVVLKYDHKFIENIGYVLYGIYNVTMVVVL
LNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARSKLWLSYFDDGKTLPPPFSLVPS
PKSFVYFIMRIVNFPKCRRRRLQKDIEMGMGNSKSRLNLFTQSNSRVFES
HSFNSILNQPTRYQQIMKRLIKRYVLKAQVDKENDEVNEGELKEIKQDIS
SLRYELLEDKSQATEELAILIHKLSEKLNPSMLRCE

Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані.

Література

  • Xu X.-Z.S., Li H.-S., Guggino W.B., Montell C. (1997). Coassembly of TRP and TRPL produces a distinct store-operated conductance. Cell. 89: 1155—1164. PMID 9215637 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80302-5
  • Yildirim E., Kawasaki B.T., Birnbaumer L. (2005). Molecular cloning of TRPC3a, an N-terminally extended, store-operated variant of the human C3 transient receptor potential channel. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 3307—3311. PMID 15728370 DOI:10.1073/pnas.0409908102
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Vannier B., Zhu X., Brown D., Birnbaumer L. (1998). The membrane topology of human transient receptor potential 3 as inferred from glycosylation-scanning mutagenesis and epitope immunocytochemistry. J. Biol. Chem. 273: 8675—8679. PMID 9535843 DOI:10.1074/jbc.273.15.8675
  • Zhu X., Jiang M., Birnbaumer L. (1998). Receptor-activated Ca2+ influx via human Trp3 stably expressed in human embryonic kidney (HEK)293 cells. Evidence for a non-capacitative Ca2+ entry. J. Biol. Chem. 273: 133—142. PMID 9417057 DOI:10.1074/jbc.273.1.133
  • Lussier M.P., Lepage P.K., Bousquet S.M., Boulay G. (2008). RNF24, a new TRPC interacting protein, causes the intracellular retention of TRPC. Cell Calcium. 43: 432—443. PMID 17850865 DOI:10.1016/j.ceca.2007.07.009

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з TRPC3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily C member 3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12335 (англ.) . Архів оригіналу за 26 березня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
  6. UniProt, Q13507 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 4
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
 
Ліганд-залежні
Потенціалкеровані
  • L-тип/Cavα
  • N-тип/Cavα2.2
  • P-тип/Cavα
  • Q-тип/Cavα2.1
  • R-тип/Cavα2.3
  • T-тип/Cavα
 
постійно відчинені
Протончутливі
  • Кислота
Потенціалкеровані
 
K+: Калієві канали
Кальцій-активовані
Вхідного випрямлення
Двопородоменні
Потенціалкеровані
 
Різні
Cl: Хлорні канали
H+: Протонні канали
M+: CNG-канали
M+: TRP-канали
H2O (+ розчини): Порини
Цитоплазма: Щілинні контакти
 
За механізмом залежності
Ion channel class