HCN3 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | HCN3, hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609973 MGI: 1298211 HomoloGene: 22453 GeneCards: HCN3 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
івабрадин[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • potassium channel activity • cAMP binding • sodium channel activity • voltage-gated ion channel activity • ion channel activity • voltage-gated potassium channel activity • voltage-gated sodium channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • синапс • neuronal cell body • аксон • дендрит (нейробіологія) • cone cell pedicle • integral component of plasma membrane |
---|
Біологічний процес | • sodium ion transmembrane transport • sodium ion transport • cellular response to dopamine • regulation of membrane potential • regulation of ion transmembrane transport • ion transport • potassium ion transport • response to cisplatin • трансмембранний транспорт • potassium ion transmembrane transport • cellular response to cAMP |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f8/PBB_GE_HCN3_gnf1h03748_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_HCN3_gnf1h03748_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000143630 ENSG00000263324 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 155.28 – 155.29 Mb | Хр. 3: 89.05 – 89.07 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
HCN3 (англ. Hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 774 амінокислот, а молекулярна маса — 86 032[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEAEQRPAAG | | ASEGATPGLE | | AVPPVAPPPA | | TAASGPIPKS | | GPEPKRRHLG |
TLLQPTVNKF | | SLRVFGSHKA | | VEIEQERVKS | | AGAWIIHPYS | | DFRFYWDLIM |
LLLMVGNLIV | | LPVGITFFKE | | ENSPPWIVFN | | VLSDTFFLLD | | LVLNFRTGIV |
VEEGAEILLA | | PRAIRTRYLR | | TWFLVDLISS | | IPVDYIFLVV | | ELEPRLDAEV |
YKTARALRIV | | RFTKILSLLR | | LLRLSRLIRY | | IHQWEEIFHM | | TYDLASAVVR |
IFNLIGMMLL | | LCHWDGCLQF | | LVPMLQDFPP | | DCWVSINHMV | | NHSWGRQYSH |
ALFKAMSHML | | CIGYGQQAPV | | GMPDVWLTML | | SMIVGATCYA | | MFIGHATALI |
QSLDSSRRQY | | QEKYKQVEQY | | MSFHKLPADT | | RQRIHEYYEH | | RYQGKMFDEE |
SILGELSEPL | | REEIINFTCR | | GLVAHMPLFA | | HADPSFVTAV | | LTKLRFEVFQ |
PGDLVVREGS | | VGRKMYFIQH | | GLLSVLARGA | | RDTRLTDGSY | | FGEICLLTRG |
RRTASVRADT | | YCRLYSLSVD | | HFNAVLEEFP | | MMRRAFETVA | | MDRLLRIGKK |
NSILQRKRSE | | PSPGSSGGIM | | EQHLVQHDRD | | MARGVRGRAP | | STGAQLSGKP |
VLWEPLVHAP | | LQAAAVTSNV | | AIALTHQRGP | | LPLSPDSPAT | | LLARSAWRSA |
GSPASPLVPV | | RAGPWASTSR | | LPAPPARTLH | | ASLSRAGRSQ | | VSLLGPPPGG |
GGRRLGPRGR | | PLSASQPSLP | | QRATGDGSPG | | RKGSGSERLP | | PSGLLAKPPR |
TAQPPRPPVP | | EPATPRGLQL | | SANM |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, транспорт натрію, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, калію, іоном натрію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Stieber J., Stockl G., Herrmann S., Hassfurth B., Hofmann F. (2005). Functional expression of the human HCN3 channel. J. Biol. Chem. 280: 34635—34643. PMID 16043489 DOI:10.1074/jbc.M502508200
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19183 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9P1Z3 (англ.) . Архів оригіналу за 4 травня 2018. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
| |
---|
| Ліганд-залежні | |
---|
| Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
| | |
---|
| постійно відчинені | |
---|
| Протончутливі | |
---|
| Потенціалкеровані | |
---|
|
| | K+: Калієві канали |
---|
| Кальцій-активовані | |
---|
| Вхідного випрямлення | |
---|
| Двопородоменні | |
---|
| Потенціалкеровані | |
---|
|
| | | | |
|