HCN3

Ідентифікатори

Символи

HCN3, hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3

Зовнішні ІД

OMIM: 609973 MGI: 1298211 HomoloGene: 22453 GeneCards: HCN3

Реагує на сполуку

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • potassium channel activity • cAMP binding • sodium channel activity • voltage-gated ion channel activity • ion channel activity • voltage-gated potassium channel activity • voltage-gated sodium channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • синапс • neuronal cell body • аксон • дендрит (нейробіологія) • cone cell pedicle • integral component of plasma membrane
Біологічний процес	• sodium ion transmembrane transport • sodium ion transport • cellular response to dopamine • regulation of membrane potential • regulation of ion transmembrane transport • ion transport • potassium ion transport • response to cisplatin • трансмембранний транспорт • potassium ion transmembrane transport • cellular response to cAMP
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


57657


15168

Ensembl


ENSG00000143630 ENSG00000263324


ENSMUSG00000028051

UniProt


Q9P1Z3


O88705

RefSeq (мРНК)


NM_020897


NM_008227

RefSeq (білок)


NP_065948


NP_032253

Локус (UCSC)

Хр. 1: 155.28 – 155.29 Mb

Хр. 3: 89.05 – 89.07 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HCN3 (англ. Hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 774 амінокислот, а молекулярна маса — 86 032^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEAEQRPAAG	ASEGATPGLE	AVPPVAPPPA	TAASGPIPKS	GPEPKRRHLG
TLLQPTVNKF	SLRVFGSHKA	VEIEQERVKS	AGAWIIHPYS	DFRFYWDLIM
LLLMVGNLIV	LPVGITFFKE	ENSPPWIVFN	VLSDTFFLLD	LVLNFRTGIV
VEEGAEILLA	PRAIRTRYLR	TWFLVDLISS	IPVDYIFLVV	ELEPRLDAEV
YKTARALRIV	RFTKILSLLR	LLRLSRLIRY	IHQWEEIFHM	TYDLASAVVR
IFNLIGMMLL	LCHWDGCLQF	LVPMLQDFPP	DCWVSINHMV	NHSWGRQYSH
ALFKAMSHML	CIGYGQQAPV	GMPDVWLTML	SMIVGATCYA	MFIGHATALI
QSLDSSRRQY	QEKYKQVEQY	MSFHKLPADT	RQRIHEYYEH	RYQGKMFDEE
SILGELSEPL	REEIINFTCR	GLVAHMPLFA	HADPSFVTAV	LTKLRFEVFQ
PGDLVVREGS	VGRKMYFIQH	GLLSVLARGA	RDTRLTDGSY	FGEICLLTRG
RRTASVRADT	YCRLYSLSVD	HFNAVLEEFP	MMRRAFETVA	MDRLLRIGKK
NSILQRKRSE	PSPGSSGGIM	EQHLVQHDRD	MARGVRGRAP	STGAQLSGKP
VLWEPLVHAP	LQAAAVTSNV	AIALTHQRGP	LPLSPDSPAT	LLARSAWRSA
GSPASPLVPV	RAGPWASTSR	LPAPPARTLH	ASLSRAGRSQ	VSLLGPPPGG
GGRRLGPRGR	PLSASQPSLP	QRATGDGSPG	RKGSGSERLP	PSGLLAKPPR
TAQPPRPPVP	EPATPRGLQL	SANM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, транспорт натрію, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, калію, іоном натрію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Stieber J., Stockl G., Herrmann S., Hassfurth B., Hofmann F. (2005). Functional expression of the human HCN3 channel. J. Biol. Chem. 280: 34635—34643. PMID 16043489 DOI:10.1074/jbc.M502508200

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19183 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9P1Z3 (англ.) . Архів оригіналу за 4 травня 2018. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані