SCN10A

Ідентифікатори

Символи

SCN10A, FEPS2, Nav1.8, PN3, SNS, hPN3, sodium voltage-gated channel alpha subunit 10

Зовнішні ІД

OMIM: 604427 MGI: 108029 HomoloGene: 21300 GeneCards: SCN10A

Пов'язані генетичні захворювання

Реагує на сполуку

mephenytoin, dibucaine hydrochloride, indecainide, oxybuprocaine, окскарбазепін, Irampanel, dichlorobenzyl alcohol, priralfinamide, Evenamide, лідокаїн, зонісамід, топірамат, chloroprocaine hydrochloride, eslicarbazepine, quinidine gluconate, disopyramide phosphate, dyclonine hydrochloride, mepivacaine hydrochloride, (RS)-mexiletine hydrochloride, orphenadrine citrate, procainamide hydrochloride, propafenone hydrochloride, benoxinate hydrochloride, prilocaine hydrochloride^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• voltage-gated sodium channel activity • ion channel activity • transmembrane transporter binding • sodium channel activity • voltage-gated ion channel activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • voltage-gated sodium channel complex • мембрана • Клатрин • екзосома • клітинна мембрана • аксон • glutamatergic synapse • integral component of presynaptic membrane
Біологічний процес	• bundle of His cell action potential • sodium ion transmembrane transport • трансмембранний транспорт • neuronal action potential • регуляція серцевого ритму • regulation of atrial cardiac muscle cell membrane depolarization • membrane depolarization during action potential • sensory perception of pain • regulation of ion transmembrane transport • ion transport • regulation of cardiac muscle contraction • AV node cell action potential • sodium ion transport • odontogenesis of dentin-containing tooth • sensory perception • regulation of postsynaptic membrane potential • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6336


20264

Ensembl


ENSG00000185313


ENSMUSG00000034533

UniProt


Q9Y5Y9


Q6QIY3

RefSeq (мРНК)


NM_001293306 NM_001293307 NM_006514


NM_001205321 NM_009134

RefSeq (білок)


NP_001280235 NP_001280236 NP_006505


NP_001192250 NP_033160

Локус (UCSC)

Хр. 3: 38.7 – 38.82 Mb

Хр. 9: 119.44 – 119.55 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SCN10A (англ. Sodium voltage-gated channel alpha subunit 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 956 амінокислот, а молекулярна маса — 220 626^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEFPIGSLET	NNFRRFTPES	LVEIEKQIAA	KQGTKKAREK	HREQKDQEEK
PRPQLDLKAC	NQLPKFYGEL	PAELIGEPLE	DLDPFYSTHR	TFMVLNKGRT
ISRFSATRAL	WLFSPFNLIR	RTAIKVSVHS	WFSLFITVTI	LVNCVCMTRT
DLPEKIEYVF	TVIYTFEALI	KILARGFCLN	EFTYLRDPWN	WLDFSVITLA
YVGTAIDLRG	ISGLRTFRVL	RALKTVSVIP	GLKVIVGALI	HSVKKLADVT
ILTIFCLSVF	ALVGLQLFKG	NLKNKCVKND	MAVNETTNYS	SHRKPDIYIN
KRGTSDPLLC	GNGSDSGHCP	DGYICLKTSD	NPDFNYTSFD	SFAWAFLSLF
RLMTQDSWER	LYQQTLRTSG	KIYMIFFVLV	IFLGSFYLVN	LILAVVTMAY
EEQNQATTDE	IEAKEKKFQE	ALEMLRKEQE	VLAALGIDTT	SLHSHNGSPL
TSKNASERRH	RIKPRVSEGS	TEDNKSPRSD	PYNQRRMSFL	GLASGKRRAS
HGSVFHFRSP	GRDISLPEGV	TDDGVFPGDH	ESHRGSLLLG	GGAGQQGPLP
RSPLPQPSNP	DSRHGEDEHQ	PPPTSELAPG	AVDVSAFDAG	QKKTFLSAEY
LDEPFRAQRA	MSVVSIITSV	LEELEESEQK	CPPCLTSLSQ	KYLIWDCCPM
WVKLKTILFG	LVTDPFAELT	ITLCIVVNTI	FMAMEHHGMS	PTFEAMLQIG
NIVFTIFFTA	EMVFKIIAFD	PYYYFQKKWN	IFDCIIVTVS	LLELGVAKKG
SLSVLRSFRL	LRVFKLAKSW	PTLNTLIKII	GNSVGALGNL	TIILAIIVFV
FALVGKQLLG	ENYRNNRKNI	SAPHEDWPRW	HMHDFFHSFL	IVFRILCGEW
IENMWACMEV	GQKSICLILF	LTVMVLGNLV	VLNLFIALLL	NSFSADNLTA
PEDDGEVNNL	QVALARIQVF	GHRTKQALCS	FFSRSCPFPQ	PKAEPELVVK
LPLSSSKAEN	HIAANTARGS	SGGLQAPRGP	RDEHSDFIAN	PTVWVSVPIA
EGESDLDDLE	DDGGEDAQSF	QQEVIPKGQQ	EQLQQVERCG	DHLTPRSPGT
GTSSEDLAPS	LGETWKDESV	PQVPAEGVDD	TSSSEGSTVD	CLDPEEILRK
IPELADDLEE	PDDCFTEGCI	RHCPCCKLDT	TKSPWDVGWQ	VRKTCYRIVE
HSWFESFIIF	MILLSSGSLA	FEDYYLDQKP	TVKALLEYTD	RVFTFIFVFE
MLLKWVAYGF	KKYFTNAWCW	LDFLIVNISL	ISLTAKILEY	SEVAPIKALR
TLRALRPLRA	LSRFEGMRVV	VDALVGAIPS	IMNVLLVCLI	FWLIFSIMGV
NLFAGKFWRC	INYTDGEFSL	VPLSIVNNKS	DCKIQNSTGS	FFWVNVKVNF
DNVAMGYLAL	LQVATFKGWM	DIMYAAVDSR	EVNMQPKWED	NVYMYLYFVI
FIIFGGFFTL	NLFVGVIIDN	FNQQKKKLGG	QDIFMTEEQK	KYYNAMKKLG
SKKPQKPIPR	PLNKFQGFVF	DIVTRQAFDI	TIMVLICLNM	ITMMVETDDQ
SEEKTKILGK	INQFFVAVFT	GECVMKMFAL	RQYYFTNGWN	VFDFIVVVLS
IASLIFSAIL	KSLQSYFSPT	LFRVIRLARI	GRILRLIRAA	KGIRTLLFAL
MMSLPALFNI	GLLLFLVMFI	YSIFGMSSFP	HVRWEAGIDD	MFNFQTFANS
MLCLFQITTS	AGWDGLLSPI	LNTGPPYCDP	NLPNSNGTRG	DCGSPAVGII
FFTTYIIISF	LIMVNMYIAV	ILENFNVATE	ESTEPLSEDD	FDMFYETWEK
FDPEATQFIT	FSALSDFADT	LSGPLRIPKP	NRNILIQMDL	PLVPGDKIHC
LDILFAFTKN	VLGESGELDS	LKANMEEKFM	ATNLSKSSYE	PIATTLRWKQ
EDISATVIQK	AYRSYVLHRS	MALSNTPCVP	RAEEEAASLP	DEGFVAFTAN
ENCVLPDKSE	TASATSFPPS	YESVTRGLSD	RVNMRTSSSI	QNEDEATSME
LIAPGP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт натрію, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном натрію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SCN10A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Sodium voltage-gated channel alpha subunit 10 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10582 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9Y5Y9 (англ.) . Архів оригіналу за 20 червня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані