KCNA1 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/ee/PDB_1dsx_EBI.jpg/250px-PDB_1dsx_EBI.jpg) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | KCNA1, AEMK, EA1, HBK1, HUK1, KV1.1, MBK1, MK1, RBK1, potassium voltage-gated channel subfamily A member 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 176260 MGI: 96654 HomoloGene: 183 GeneCards: KCNA1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
episodic ataxia type 1, hereditary continuous muscle fiber activity[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
Гуанідин[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • potassium channel activity • delayed rectifier potassium channel activity • voltage-gated ion channel activity • GO:0015388 potassium ion transmembrane transporter activity • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • voltage-gated potassium channel activity • disordered domain specific binding • voltage-gated ion channel activity involved in regulation of presynaptic membrane potential • voltage-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential |
---|
Клітинна компонента | • axon terminus • juxtaparanode region of axon • integral component of membrane • гіалоплазма • перикаріон • cell projection • мембрана • клітинна мембрана • синапс • integral component of plasma membrane • cell surface • міжклітинні контакти • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • аксон • potassium channel complex • apical plasma membrane • ендоплазматичний ретикулум • paranode region of axon • presynaptic membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • voltage-gated potassium channel complex • calyx of Held • glutamatergic synapse • integral component of postsynaptic membrane • integral component of presynaptic membrane |
---|
Біологічний процес | • regulation of muscle contraction • detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of pain • cellular response to magnesium ion • переляк • regulation of membrane potential • cell communication by electrical coupling • neuronal signal transduction • regulation of ion transmembrane transport • ion transport • magnesium ion homeostasis • potassium ion transport • brain development • neuromuscular process • трансмембранний транспорт • potassium ion transmembrane transport • neuroblast proliferation • detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of touch • protein homooligomerization • hippocampus development • neuronal action potential • chemical synaptic transmission • positive regulation of voltage-gated potassium channel activity • regulation of postsynaptic membrane potential • regulation of presynaptic membrane potential |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 4.91 – 4.92 Mb | Хр. 6: 126.62 – 126.62 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
KCNA1 (англ. Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 495 амінокислот, а молекулярна маса — 56 466[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTVMSGENVD | | EASAAPGHPQ | | DGSYPRQADH | | DDHECCERVV | | INISGLRFET |
QLKTLAQFPN | | TLLGNPKKRM | | RYFDPLRNEY | | FFDRNRPSFD | | AILYYYQSGG |
RLRRPVNVPL | | DMFSEEIKFY | | ELGEEAMEKF | | REDEGFIKEE | | ERPLPEKEYQ |
RQVWLLFEYP | | ESSGPARVIA | | IVSVMVILIS | | IVIFCLETLP | | ELKDDKDFTG |
TVHRIDNTTV | | IYNSNIFTDP | | FFIVETLCII | | WFSFELVVRF | | FACPSKTDFF |
KNIMNFIDIV | | AIIPYFITLG | | TEIAEQEGNQ | | KGEQATSLAI | | LRVIRLVRVF |
RIFKLSRHSK | | GLQILGQTLK | | ASMRELGLLI | | FFLFIGVILF | | SSAVYFAEAE |
EAESHFSSIP | | DAFWWAVVSM | | TTVGYGDMYP | | VTIGGKIVGS | | LCAIAGVLTI |
ALPVPVIVSN | | FNYFYHRETE | | GEEQAQLLHV | | SSPNLASDSD | | LSRRSSSTMS |
KSEYMEIEED | | MNNSIAHYRQ | | VNIRTANCTT | | ANQNCVNKSK | | LLTDV |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію. Білок має сайт для зв'язування з калію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, ендоплазматичному ретикулумі, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, синапсах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Rasband M.N., Trimmer J.S. (2001). Subunit composition and novel localization of K+ channels in spinal cord. J. Comp. Neurol. 429: 166—176. PMID 11086297 DOI:10.1002/1096-9861(20000101)429:1<166::AID-CNE13>3.0.CO;2-Y
- Hoopengardner B., Bhalla T., Staber C., Reenan R. (2003). Nervous system targets of RNA editing identified by comparative genomics. Science. 301: 832—836. PMID 12907802 DOI:10.1126/science.1086763
- Gubitosi-Klug R.A., Mancuso D.J., Gross R.W. (2005). The human Kv1.1 channel is palmitoylated, modulating voltage sensing: Identification of a palmitoylation consensus sequence. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 5964—5968. PMID 15837928 DOI:10.1073/pnas.0501999102
- Baranauskas G. (2007). Ionic channel function in action potential generation: current perspective. Mol. Neurobiol. 35: 129—150. PMID 17917103 DOI:10.1007/s12035-007-8001-0
- Usman H., Mathew M.K. (2010). Potassium channel regulator KCNRG regulates surface expression of Shaker-type potassium channels. Biochem. Biophys. Res. Commun. 391: 1301—1305. PMID 19968958 DOI:10.1016/j.bbrc.2009.11.143
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з KCNA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6218 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q09470 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
| |
---|
| Ліганд-залежні | |
---|
| Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
| | |
---|
| постійно відчинені | |
---|
| Протончутливі | |
---|
| Потенціалкеровані | |
---|
|
| | K+: Калієві канали |
---|
| Кальцій-активовані | |
---|
| Вхідного випрямлення | |
---|
| Двопородоменні | |
---|
| Потенціалкеровані | |
---|
|
| | | | |
|