KCNA1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2AFL

Ідентифікатори

Символи

KCNA1, AEMK, EA1, HBK1, HUK1, KV1.1, MBK1, MK1, RBK1, potassium voltage-gated channel subfamily A member 1

Зовнішні ІД

OMIM: 176260 MGI: 96654 HomoloGene: 183 GeneCards: KCNA1

Пов'язані генетичні захворювання

episodic ataxia type 1, hereditary continuous muscle fiber activity^[1]

Реагує на сполуку

Гуанідин^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• potassium channel activity • delayed rectifier potassium channel activity • voltage-gated ion channel activity • GO:0015388 potassium ion transmembrane transporter activity • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • voltage-gated potassium channel activity • disordered domain specific binding • voltage-gated ion channel activity involved in regulation of presynaptic membrane potential • voltage-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential
Клітинна компонента	• axon terminus • juxtaparanode region of axon • integral component of membrane • гіалоплазма • перикаріон • cell projection • мембрана • клітинна мембрана • синапс • integral component of plasma membrane • cell surface • міжклітинні контакти • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • аксон • potassium channel complex • apical plasma membrane • ендоплазматичний ретикулум • paranode region of axon • presynaptic membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • voltage-gated potassium channel complex • calyx of Held • glutamatergic synapse • integral component of postsynaptic membrane • integral component of presynaptic membrane
Біологічний процес	• regulation of muscle contraction • detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of pain • cellular response to magnesium ion • переляк • regulation of membrane potential • cell communication by electrical coupling • neuronal signal transduction • regulation of ion transmembrane transport • ion transport • magnesium ion homeostasis • potassium ion transport • brain development • neuromuscular process • трансмембранний транспорт • potassium ion transmembrane transport • neuroblast proliferation • detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of touch • protein homooligomerization • hippocampus development • neuronal action potential • chemical synaptic transmission • positive regulation of voltage-gated potassium channel activity • regulation of postsynaptic membrane potential • regulation of presynaptic membrane potential
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3736


16485

Ensembl


ENSG00000111262


ENSMUSG00000047976

UniProt


Q09470


P16388

RefSeq (мРНК)


NM_000217


NM_010595

RefSeq (білок)


NP_000208


NP_034725

Локус (UCSC)

Хр. 12: 4.91 – 4.92 Mb

Хр. 6: 126.62 – 126.62 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

KCNA1 (англ. Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 495 амінокислот, а молекулярна маса — 56 466^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTVMSGENVD	EASAAPGHPQ	DGSYPRQADH	DDHECCERVV	INISGLRFET
QLKTLAQFPN	TLLGNPKKRM	RYFDPLRNEY	FFDRNRPSFD	AILYYYQSGG
RLRRPVNVPL	DMFSEEIKFY	ELGEEAMEKF	REDEGFIKEE	ERPLPEKEYQ
RQVWLLFEYP	ESSGPARVIA	IVSVMVILIS	IVIFCLETLP	ELKDDKDFTG
TVHRIDNTTV	IYNSNIFTDP	FFIVETLCII	WFSFELVVRF	FACPSKTDFF
KNIMNFIDIV	AIIPYFITLG	TEIAEQEGNQ	KGEQATSLAI	LRVIRLVRVF
RIFKLSRHSK	GLQILGQTLK	ASMRELGLLI	FFLFIGVILF	SSAVYFAEAE
EAESHFSSIP	DAFWWAVVSM	TTVGYGDMYP	VTIGGKIVGS	LCAIAGVLTI
ALPVPVIVSN	FNYFYHRETE	GEEQAQLLHV	SSPNLASDSD	LSRRSSSTMS
KSEYMEIEED	MNNSIAHYRQ	VNIRTANCTT	ANQNCVNKSK	LLTDV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію. Білок має сайт для зв'язування з калію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, ендоплазматичному ретикулумі, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Rasband M.N., Trimmer J.S. (2001). Subunit composition and novel localization of K+ channels in spinal cord. J. Comp. Neurol. 429: 166—176. PMID 11086297 DOI:10.1002/1096-9861(20000101)429:1<166::AID-CNE13>3.0.CO;2-Y
Hoopengardner B., Bhalla T., Staber C., Reenan R. (2003). Nervous system targets of RNA editing identified by comparative genomics. Science. 301: 832—836. PMID 12907802 DOI:10.1126/science.1086763
Gubitosi-Klug R.A., Mancuso D.J., Gross R.W. (2005). The human Kv1.1 channel is palmitoylated, modulating voltage sensing: Identification of a palmitoylation consensus sequence. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 5964—5968. PMID 15837928 DOI:10.1073/pnas.0501999102
Baranauskas G. (2007). Ionic channel function in action potential generation: current perspective. Mol. Neurobiol. 35: 129—150. PMID 17917103 DOI:10.1007/s12035-007-8001-0
Usman H., Mathew M.K. (2010). Potassium channel regulator KCNRG regulates surface expression of Shaker-type potassium channels. Biochem. Biophys. Res. Commun. 391: 1301—1305. PMID 19968958 DOI:10.1016/j.bbrc.2009.11.143

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з KCNA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6218 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q09470 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані