CLNS1A

Ідентифікатори

Символи

CLNS1A, CLCI, CLNS1B, ICln, chloride nucleotide-sensitive channel 1A

Зовнішні ІД

OMIM: 602158 MGI: 109638 HomoloGene: 990 GeneCards: CLNS1A

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein heterodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding
Клітинна компонента	• клітинна мембрана • цитоскелет • нуклеоплазма • клітинне ядро • methylosome • pICln-Sm protein complex • гіалоплазма • цитоплазма
Біологічний процес	• cell volume homeostasis • chloride transport • spliceosomal snRNP assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1207


12729

Ensembl


ENSG00000074201


ENSMUSG00000025439

UniProt


P54105


Q61189 Q923F1

RefSeq (мРНК)


NM_001311202 NM_001293 NM_001311199 NM_001311200 NM_001311201


NM_023671

RefSeq (білок)


NP_001284 NP_001298128 NP_001298129 NP_001298130 NP_001298131


NP_076160

Локус (UCSC)

Хр. 11: 77.51 – 77.64 Mb

Хр. 7: 97.35 – 97.37 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CLNS1A (англ. Chloride nucleotide-sensitive channel 1A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 237 амінокислот, а молекулярна маса — 26 215^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSFLKSFPPP	GPAEGLLRQQ	PDTEAVLNGK	GLGTGTLYIA	ESRLSWLDGS
GLGFSLEYPT	ISLHALSRDR	SDCLGEHLYV	MVNAKFEEES	KEPVADEEEE
DSDDDVEPIT	EFRFVPSDKS	ALEAMFTAMC	ECQALHPDPE	DEDSDDYDGE
EYDVEAHEQG	QGDIPTFYTY	EEGLSHLTAE	GQATLERLEG	MLSQSVSSQY
NMAGVRTEDS	IRDYEDGMEV	DTTPTVAGQF	EDADVDH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

Anquita J., Chalfant M.L., Civan M.M., Coca-Prados M. (1995). Molecular cloning of the human volume-sensitive chloride conductance regulatory protein, pICln, from ocular ciliary epithelium. Biochem. Biophys. Res. Commun. 208: 89—95. PMID 7887970 DOI:10.1006/bbrc.1995.1309
Schwartz R.S., Rybicki A.C., Nagel R.L. (1997). Molecular cloning and expression of a chloride channel-associated protein pI(Cln) in human young red blood cells: association with actin. Biochem. J. 327: 609—616. PMID 9359436 DOI:10.1042/bj3270609
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Pu W.T., Krapivinsky G.B., Krapivinsky L., Clapham D.E. (1999). pICln inhibits snRNP biogenesis by binding core spliceosomal proteins. Mol. Cell. Biol. 19: 4113—4120. PMID 10330151 DOI:10.1128/MCB.19.6.4113
Giorgianni F., Zhao Y., Desiderio D.M., Beranova-Giorgianni S. (2007). Toward a global characterization of the phosphoproteome in prostate cancer cells: identification of phosphoproteins in the LNCaP cell line. Electrophoresis. 28: 2027—2034. PMID 17487921 DOI:10.1002/elps.200600782

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2080 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P54105 (англ.) . Архів оригіналу за 6 квітня 2018. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані