TRPV6

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2RFA

Ідентифікатори

Символи

TRPV6, ABP/ZF, CAT1, CATL, ECAC2, HSA277909, LP6728, ZFAB, transient receptor potential cation channel subfamily V member 6, HRPTTN

Зовнішні ІД

OMIM: 606680 MGI: 1927259 HomoloGene: 56812 GeneCards: TRPV6

Пов'язані генетичні захворювання

transient neonatal hyperparathyroidism^[1]

Реагує на сполуку

2-aminoethoxydiphenylborate^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calmodulin binding • calcium channel activity • зв'язування з іоном металу
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane
Біологічний процес	• ion transport • calcium ion transport • regulation of calcium ion-dependent exocytosis • response to calcium ion • calcium ion transmembrane transport • трансмембранний транспорт • calcium ion homeostasis • calcium ion import across plasma membrane
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55503


64177

Ensembl


ENSG00000276971 ENSG00000165125


ENSMUSG00000029868

UniProt


Q9H1D0


Q91WD2

RefSeq (мРНК)


NM_018646 NM_014274


NM_022413

RefSeq (білок)


NP_061116


NP_071858

Локус (UCSC)

Хр. 7: 142.87 – 142.89 Mb

Хр. 6: 41.6 – 41.61 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRPV6 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily V member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 765 амінокислот, а молекулярна маса — 87 286^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGPLQGDGGP	ALGGADVAPR	LSPVRVWPRP	QAPKEPALHP	MGLSLPKEKG
LILCLWSKFC	RWFQRRESWA	QSRDEQNLLQ	QKRIWESPLL	LAAKDNDVQA
LNKLLKYEDC	KVHQRGAMGE	TALHIAALYD	NLEAAMVLME	AAPELVFEPM
TSELYEGQTA	LHIAVVNQNM	NLVRALLARR	ASVSARATGT	AFRRSPCNLI
YFGEHPLSFA	ACVNSEEIVR	LLIEHGADIR	AQDSLGNTVL	HILILQPNKT
FACQMYNLLL	SYDRHGDHLQ	PLDLVPNHQG	LTPFKLAGVE	GNTVMFQHLM
QKRKHTQWTY	GPLTSTLYDL	TEIDSSGDEQ	SLLELIITTK	KREARQILDQ
TPVKELVSLK	WKRYGRPYFC	MLGAIYLLYI	ICFTMCCIYR	PLKPRTNNRT
SPRDNTLLQQ	KLLQEAYMTP	KDDIRLVGEL	VTVIGAIIIL	LVEVPDIFRM
GVTRFFGQTI	LGGPFHVLII	TYAFMVLVTM	VMRLISASGE	VVPMSFALVL
GWCNVMYFAR	GFQMLGPFTI	MIQKMIFGDL	MRFCWLMAVV	ILGFASAFYI
IFQTEDPEEL	GHFYDYPMAL	FSTFELFLTI	IDGPANYNVD	LPFMYSITYA
AFAIIATLLM	LNLLIAMMGD	THWRVAHERD	ELWRAQIVAT	TVMLERKLPR
CLWPRSGICG	REYGLGDRWF	LRVEDRQDLN	RQRIQRYAQA	FHTRGSEDLD
KDSVEKLELG	CPFSPHLSLP	MPSVSRSTSR	SSANWERLRQ	GTLRRDLRGI
INRGLEDGES	WEYQI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну, іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Wood R.J., Tchack L., Taparia S. (2001). 1,25-dihydroxyvitamin D3 increases the expression of the CaT1 epithelial calcium channel in the Caco-2 human intestinal cell line. BMC Physiol. 1: 11—11. PMID 11545681 DOI:10.1186/1472-6793-1-11
Peng J.-B., Brown E.M., Hediger M.A. (2001). Structural conservation of the genes encoding CaT1, CaT2, and related cation channels. Genomics. 76: 99—109. PMID 11549322 DOI:10.1006/geno.2001.6606
Niemeyer B.A., Bergs C., Wissenbach U., Flockerzi V., Trost C. (2001). Competitive regulation of CaT-like-mediated Ca2+ entry by protein kinase C and calmodulin. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 3600—3605. PMID 11248124 DOI:10.1073/pnas.051511398
Bodding M., Flockerzi V. (2004). Ca2+ dependence of the Ca2+-selective TRPV6 channel. J. Biol. Chem. 279: 36546—36552. PMID 15184369 DOI:10.1074/jbc.M404679200

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TRPV6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily V member 6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14006 (англ.) . Архів оригіналу за 23 травня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9H1D0 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 7

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Кальцій у біології

Обмін кальцію^[en]

Кальцитонін • Кальцитріол • Паратгормон • TRPV6

Транспорт кальцію

Кальцієві канали	Потенціалкеровані L-типу N-типу P/Q-типу R-типу T-типу Інші TRP-канали NMDA-рецептори Ріанодиновий рецептор Рецептор інозитолтрифосфату^[en] уніпортер мітохондрій^[en]

Кальцієві транспортери	Кальцієві помпи^[en] плазмалеми^[en] сакроплазматичного ретикулуму^[en] Кальцієві обмінники натрій-кальцієвий кальцій-протонний^[en]

Кальцієва сигналізація

Кальцій-зв'язувальні білки	Кальмодулін Тропонін Кальнексин Кальбіндін Кальретикулін Кальцій-чутливий рецептор

Шляхи сигналізації	Фосфоліпаза C Інозитолтрифосфат^[en] Діацилгліцерол

Компартменталізація кальцію	Кальцієве депо ядра^[en] Кальцієве депо ендоплазматичного ретикулуму Кальцієве депо мітохондрій Система Т-трубочок^[en]

Кістки і зуби

Остеоцит • Остеобласт • Остеокласт • Гідроксилапатит • Зубна емаль • Дентин

У інших тварин

Мушля • Яєчна шкаралупа • Спікули губок

У рослин

Оксалат кальцію^[en]

Порушення обміну кальцію^[en]

Кальцифікація • Кальциноз • Гіперкальціємія • Гіпокальціємія^[en] • Остеопороз • Рахіт • Остеомаляція

Кальцій-чутливі зонди^[en]

Fluo-3^[en] • Indo-1^[en] • Fura-2^[en] • GCaMP^[en] • Cameleon^[en] • Екворін^[en] • Кальцієві спалахи^[en] • Кальцій-залежний вихід кальцію^[en]

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані