TRPV6 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRPV6, ABP/ZF, CAT1, CATL, ECAC2, HSA277909, LP6728, ZFAB, transient receptor potential cation channel subfamily V member 6, HRPTTN |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606680 MGI: 1927259 HomoloGene: 56812 GeneCards: TRPV6 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
transient neonatal hyperparathyroidism[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
2-aminoethoxydiphenylborate[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calmodulin binding • calcium channel activity • зв'язування з іоном металу |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane |
---|
Біологічний процес | • ion transport • calcium ion transport • regulation of calcium ion-dependent exocytosis • response to calcium ion • calcium ion transmembrane transport • трансмембранний транспорт • calcium ion homeostasis • calcium ion import across plasma membrane |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/7e/PBB_GE_TRPV6_206827_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_TRPV6_206827_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000276971 ENSG00000165125 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 7: 142.87 – 142.89 Mb | Хр. 6: 41.6 – 41.61 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRPV6 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily V member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 765 амінокислот, а молекулярна маса — 87 286[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGPLQGDGGP | | ALGGADVAPR | | LSPVRVWPRP | | QAPKEPALHP | | MGLSLPKEKG |
LILCLWSKFC | | RWFQRRESWA | | QSRDEQNLLQ | | QKRIWESPLL | | LAAKDNDVQA |
LNKLLKYEDC | | KVHQRGAMGE | | TALHIAALYD | | NLEAAMVLME | | AAPELVFEPM |
TSELYEGQTA | | LHIAVVNQNM | | NLVRALLARR | | ASVSARATGT | | AFRRSPCNLI |
YFGEHPLSFA | | ACVNSEEIVR | | LLIEHGADIR | | AQDSLGNTVL | | HILILQPNKT |
FACQMYNLLL | | SYDRHGDHLQ | | PLDLVPNHQG | | LTPFKLAGVE | | GNTVMFQHLM |
QKRKHTQWTY | | GPLTSTLYDL | | TEIDSSGDEQ | | SLLELIITTK | | KREARQILDQ |
TPVKELVSLK | | WKRYGRPYFC | | MLGAIYLLYI | | ICFTMCCIYR | | PLKPRTNNRT |
SPRDNTLLQQ | | KLLQEAYMTP | | KDDIRLVGEL | | VTVIGAIIIL | | LVEVPDIFRM |
GVTRFFGQTI | | LGGPFHVLII | | TYAFMVLVTM | | VMRLISASGE | | VVPMSFALVL |
GWCNVMYFAR | | GFQMLGPFTI | | MIQKMIFGDL | | MRFCWLMAVV | | ILGFASAFYI |
IFQTEDPEEL | | GHFYDYPMAL | | FSTFELFLTI | | IDGPANYNVD | | LPFMYSITYA |
AFAIIATLLM | | LNLLIAMMGD | | THWRVAHERD | | ELWRAQIVAT | | TVMLERKLPR |
CLWPRSGICG | | REYGLGDRWF | | LRVEDRQDLN | | RQRIQRYAQA | | FHTRGSEDLD |
KDSVEKLELG | | CPFSPHLSLP | | MPSVSRSTSR | | SSANWERLRQ | | GTLRRDLRGI |
INRGLEDGES | | WEYQI |
Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну, іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Wood R.J., Tchack L., Taparia S. (2001). 1,25-dihydroxyvitamin D3 increases the expression of the CaT1 epithelial calcium channel in the Caco-2 human intestinal cell line. BMC Physiol. 1: 11—11. PMID 11545681 DOI:10.1186/1472-6793-1-11
- Peng J.-B., Brown E.M., Hediger M.A. (2001). Structural conservation of the genes encoding CaT1, CaT2, and related cation channels. Genomics. 76: 99—109. PMID 11549322 DOI:10.1006/geno.2001.6606
- Niemeyer B.A., Bergs C., Wissenbach U., Flockerzi V., Trost C. (2001). Competitive regulation of CaT-like-mediated Ca2+ entry by protein kinase C and calmodulin. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 3600—3605. PMID 11248124 DOI:10.1073/pnas.051511398
- Bodding M., Flockerzi V. (2004). Ca2+ dependence of the Ca2+-selective TRPV6 channel. J. Biol. Chem. 279: 36546—36552. PMID 15184369 DOI:10.1074/jbc.M404679200
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TRPV6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily V member 6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14006 (англ.) . Архів оригіналу за 23 травня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9H1D0 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
| Обмін кальцію[en] | |
---|
| Транспорт кальцію | Кальцієві канали | - Потенціалкеровані
- L-типу
- N-типу
- P/Q-типу
- R-типу
- T-типу
- Інші
|
---|
| Кальцієві транспортери | - Кальцієві помпи[en]
- плазмалеми[en]
- сакроплазматичного ретикулуму[en]
- Кальцієві обмінники
|
---|
|
---|
| Кальцієва сигналізація | Кальцій-зв'язувальні білки | |
---|
| Шляхи сигналізації | |
---|
| Компартменталізація кальцію | - Кальцієве депо ядра[en]
- Кальцієве депо ендоплазматичного ретикулуму
- Кальцієве депо мітохондрій
- Система Т-трубочок[en]
|
---|
|
---|
| Кістки і зуби | |
---|
| У інших тварин | |
---|
| У рослин | Оксалат кальцію[en] |
---|
| Порушення обміну кальцію[en] | |
---|
| Кальцій-чутливі зонди[en] | Fluo-3[en] • Indo-1[en] • Fura-2[en] • GCaMP[en] • Cameleon[en] • Екворін[en] • Кальцієві спалахи[en] • Кальцій-залежний вихід кальцію[en] |
---|
|
|
---|
| |
---|
| Ліганд-залежні | |
---|
| Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
| | |
---|
| постійно відчинені | |
---|
| Протончутливі | |
---|
| Потенціалкеровані | |
---|
|
| | K+: Калієві канали |
---|
| Кальцій-активовані | |
---|
| Вхідного випрямлення | |
---|
| Двопородоменні | |
---|
| Потенціалкеровані | |
---|
|
| | | | |
|